54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1490 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1490  amidophosphoribosyltransferases-like protein  100 
 
 
221 aa  456  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.00000000336577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  27.6 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 
245 aa  59.3  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  25.43 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  26.11 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
247 aa  55.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  24.66 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3203  amidophosphoribosyltransferase family protein  27.52 
 
 
274 aa  55.5  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.610875  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  31.48 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  30.45 
 
 
260 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  28.5 
 
 
247 aa  52.4  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  25 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
279 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  26.45 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  25.59 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  25.93 
 
 
246 aa  48.9  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 
248 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 
239 aa  48.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  26.07 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.4 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  25.37 
 
 
249 aa  47  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  25.6 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  27.82 
 
 
249 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 
276 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  23.94 
 
 
230 aa  45.8  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0756  putative amidophosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
107 aa  45.4  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  22.79 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  23.87 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0004  amidophosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
485 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.970099  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  25.82 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  26.27 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  27.2 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  25.88 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  21.68 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  26.27 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  21.43 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  30.09 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  29.36 
 
 
270 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  31.36 
 
 
255 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1639  amidophosphoribosyltransferase  24.04 
 
 
499 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1646  amidophosphoribosyltransferase  24.04 
 
 
499 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  25.15 
 
 
228 aa  42  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19754  predicted protein  31.13 
 
 
563 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  46.81 
 
 
215 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  27.18 
 
 
255 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  23.68 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  26.79 
 
 
233 aa  41.6  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.87 
 
 
708 aa  41.6  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.13 
 
 
246 aa  41.6  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>