More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0892 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0892  peptide ABC transporter, permease protein  100 
 
 
288 aa  567  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0538689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0697  oligopeptide ABC transporter, permease  97.92 
 
 
288 aa  559  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0711  oligopeptide transport system, permease  98.26 
 
 
288 aa  555  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00783408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0964  putative ABC transporter, permease protein  97.92 
 
 
288 aa  554  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.841152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0896  putative ABC transporter, permease protein  94.44 
 
 
288 aa  534  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.06594e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.32 
 
 
316 aa  527  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0854  oligopeptide transport system permease protein OppB  93.55 
 
 
279 aa  511  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4482  putative ABC transporter, permease protein  92.71 
 
 
288 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0368611 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0762  hypothetical protein  92.89 
 
 
233 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0801  putative ABC transporter permease  92.89 
 
 
233 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2150  oligopeptide transport system, permease  48.8 
 
 
288 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.36 
 
 
288 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101451  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2493  oligopeptide transport system, permease  49.82 
 
 
288 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.700486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2424  putative transporter-like protein  49.47 
 
 
288 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2229  hypothetical protein  53.14 
 
 
207 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0499887  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0026  oligopeptide transport system permease  33.7 
 
 
301 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0763  oligopeptide transport system permease, C-terminus  100 
 
 
62 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
300 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0520251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3073  hypothetical protein  29.22 
 
 
300 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.936386  normal  0.023792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.49 
 
 
300 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0228334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2380  hypothetical protein  31.28 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0707697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2298  hypothetical protein  31.79 
 
 
335 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2113  hypothetical protein  31.28 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.187589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2052  oligopeptide transport system, permease  31.28 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000157792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2050  oligopeptide transport system, permease  31.28 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2269  hypothetical protein  31.28 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2295  hypothetical protein  31.28 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000104504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2252  hypothetical protein  29.61 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.811282  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.670185  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  26.87 
 
 
313 aa  62.4  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  30.81 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1978  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 
314 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.39 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.373556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  28.76 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4849  ABC transporter, permease  27.33 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315179  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
318 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7531  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  23.02 
 
 
390 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286515  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 
328 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
328 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00770957  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0359534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  30.95 
 
 
316 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.7 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.6653  normal  0.747134 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0445446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.43 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.19 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0338094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  23.98 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  24.39 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0253  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  26.15 
 
 
308 aa  52.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0169931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 
338 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0444198 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.81 
 
 
314 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0639  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  30.89 
 
 
313 aa  52.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.07 
 
 
313 aa  52.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112579 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0336  ABC transporter, permease protein  29.19 
 
 
306 aa  52  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0225977  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06690  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.63 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00103522  normal  0.413744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.11 
 
 
311 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0364256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0469  nickel ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 
309 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.81 
 
 
314 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0391  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.37 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.920936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.56 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488789  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.98 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627017 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.41 
 
 
321 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3222  ABC transporter, permease protein  29.76 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.92 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.000255832  decreased coverage  0.000142665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24430  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 
338 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276655  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.650812  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.36 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.84 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.77891  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  27.63 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3891  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  25.98 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
361 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  27.45 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.26 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 
328 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.892452  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.86 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.71 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.87 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.359002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1751  IM pore protein  29.41 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.03 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
459 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.559579  normal  0.431883 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.12 
 
 
318 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
336 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000749118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3714  nickel ABC transporter permease(nikB)  31.76 
 
 
315 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
315 aa  50.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.14 
 
 
320 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.25 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5710  ABC transporter, inner membrane subunit  31.15 
 
 
335 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 
341 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2541  peptide transport system permease  28.07 
 
 
321 aa  49.3  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>