161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7504 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7504  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 333 aa  666    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0408  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.81 
 
 		 438 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0469  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.16 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3594  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.29 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3036  sulfonate ABC transporter, periplamic sulfonate-binding protein  35.28 
 
 		 338 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0490  NMT1/THI5 like domain protein  28.2 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0844  ABC transporter substrate-binding protein  25.8 
 
 		 345 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  27.04 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2564  putative ABC transporter, periplasmic subunit  32.97 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5419  NMT1/THI5 like domain protein  27.62 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.25 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  26.01 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0665  NMT1/THI5 like domain protein  29.63 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0105  NMT1/THI5 like domain protein  24.18 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2969  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.27 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2283  NLPA lipoprotein  27.2 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000054697  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  26.29 
 
 		 357 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  28.02 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  29.03 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.38 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0838  taurine transporter substrate binding subunit  27.72 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2620  NMT1/THI5 like domain protein  25.93 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.985405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  25.44 
 
 		 335 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3302  putative aliphatic sulfonates-binding protein precursor (SsuA protein)  32.22 
 
 		 311 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0389  taurine transporter substrate binding subunit  26.56 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3938  taurine transporter substrate binding subunit  27.49 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0278  taurine transporter substrate binding subunit  26.56 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0258  taurine transporter substrate binding subunit  27.49 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00315  taurine transporter subunit  26.56 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3242  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.56 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00319  hypothetical protein  26.56 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  30.05 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.1 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  27.14 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0440  taurine transporter substrate binding subunit  26.56 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0428  taurine transporter substrate binding subunit  26.56 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4566  taurine transporter substrate binding subunit  26.55 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3263  taurine transporter substrate binding subunit  26.56 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.37 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.77 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.71 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0394  taurine transporter substrate binding subunit  26.56 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.560594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.29 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2365  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.23 
 
 		 324 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.626028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0154  extracellular solute-binding protein, family 3  24.42 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  30.95 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.95 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  29.69 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4154  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.54 
 
 		 367 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  25.48 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  27.39 
 
 		 343 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10968  uracil-DNA glycosylase  20.35 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.34 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  41.18 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0325  NMT1/THI5 like domain protein  29.27 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  28.22 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0833  ABC transporter, substrate binding protein  28.83 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.04 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0466  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  28.78 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.26 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.78 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  28.98 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  28.98 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  27.01 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3487  twin-arginine translocation pathway signal  30.26 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  29.52 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36967  predicted protein  22.73 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.177714  normal  0.228714 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.12 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0145  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.15 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3695  taurine transporter substrate binding subunit  26.88 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1150  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.9 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0266  NMT1/THI5 like domain protein  33.06 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.91 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  28.66 
 
 		 364 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.43 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1212  NMT1/THI5 like domain protein  29.76 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0153956  normal  0.631224 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  28.99 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3869  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 		 408 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0223785 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.2 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3748  ABC transporter, substrate binding protein  24.06 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  28.21 
 
 		 414 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  29.71 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3641  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 319 aa  46.6  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0351893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3293  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.42 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.4 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3795  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 		 408 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  28.66 
 
 		 337 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  28.65 
 
 		 342 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.49 
 
 		 351 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1859  ABC transport system substrate-binding protein  28.48 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1185  ABC transporter, substrate binding protein  29.41 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.987715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>