More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4843 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
284 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  70.68 
 
 
288 aa  343  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  68.27 
 
 
298 aa  335  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  63.42 
 
 
285 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  68.2 
 
 
281 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  61.26 
 
 
265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  64.62 
 
 
281 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  64.23 
 
 
281 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  64.23 
 
 
281 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  65.64 
 
 
281 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  68.2 
 
 
281 aa  318  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  59.69 
 
 
286 aa  305  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  58.7 
 
 
278 aa  299  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  58.04 
 
 
262 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  57.26 
 
 
261 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  56.77 
 
 
260 aa  292  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  64.81 
 
 
259 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  64.29 
 
 
286 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  57.09 
 
 
271 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  57.26 
 
 
269 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  56.63 
 
 
266 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  56.46 
 
 
279 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  57.36 
 
 
279 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
255 aa  275  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  56.69 
 
 
287 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  56.3 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  56.1 
 
 
276 aa  270  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  56.3 
 
 
291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  56.38 
 
 
267 aa  269  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  55.04 
 
 
269 aa  268  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  52.42 
 
 
259 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  55.56 
 
 
269 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  53.23 
 
 
262 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  53.69 
 
 
247 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  54.12 
 
 
270 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  51.87 
 
 
246 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  51.81 
 
 
252 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  47.33 
 
 
254 aa  255  7e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.76 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  46.8 
 
 
262 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.55 
 
 
276 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 
252 aa  250  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  46.44 
 
 
256 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  52.19 
 
 
264 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  53.44 
 
 
263 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  48.81 
 
 
267 aa  249  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  46.31 
 
 
251 aa  248  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  49.4 
 
 
258 aa  247  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  57.85 
 
 
261 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  50.77 
 
 
265 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  52.55 
 
 
276 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 
251 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  48.83 
 
 
255 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 
287 aa  245  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.21 
 
 
253 aa  245  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 
251 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  45.45 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  52.51 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.67 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  45.04 
 
 
251 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
251 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
251 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 
251 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  51.33 
 
 
266 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.97 
 
 
263 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.83 
 
 
260 aa  242  5e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  46.09 
 
 
256 aa  242  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 
254 aa  241  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  53.04 
 
 
268 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  55.29 
 
 
263 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  51.35 
 
 
263 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  51.59 
 
 
262 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.97 
 
 
253 aa  240  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.23 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.21 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1167  ABC transporter related  56.18 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.174224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  52.57 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
308 aa  239  5e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.9 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  50.98 
 
 
265 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  50.98 
 
 
265 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1327  ABC transporter related  55.78 
 
 
266 aa  238  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  47.93 
 
 
256 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  50.22 
 
 
304 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  51.61 
 
 
273 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  51.61 
 
 
273 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  47.52 
 
 
256 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.31 
 
 
254 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  51.78 
 
 
273 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.77 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  45.78 
 
 
261 aa  235  6e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  51.75 
 
 
303 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.19 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  51.75 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  54.75 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.01 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  50.41 
 
 
272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.88 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  48.98 
 
 
256 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>