More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4575 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  76.99 
 
 		 452 aa  704    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  67.41 
 
 		 453 aa  636    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  74.12 
 
 		 452 aa  700    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  76.11 
 
 		 453 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  75.44 
 
 		 453 aa  693    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  69.8 
 
 		 453 aa  651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  100 
 
 		 452 aa  908    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  56.19 
 
 		 452 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  52.33 
 
 		 473 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  52.12 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  52.37 
 
 		 485 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  50.66 
 
 		 478 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  50.66 
 
 		 478 aa  475  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  48.88 
 
 		 476 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  50.44 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  49.32 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  48.67 
 
 		 491 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  47.42 
 
 		 512 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  49.78 
 
 		 493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  48.06 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  49.77 
 
 		 460 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  46.78 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  48.29 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  47.22 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  49.33 
 
 		 485 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  49.11 
 
 		 485 aa  428  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  47.99 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  42.86 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  42.25 
 
 		 440 aa  362  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  44.64 
 
 		 459 aa  346  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  37.86 
 
 		 463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  40.86 
 
 		 551 aa  343  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  40.62 
 
 		 513 aa  342  8e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  41.96 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  39.51 
 
 		 443 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  40.99 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  40.99 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  39.73 
 
 		 544 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  41.22 
 
 		 444 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  41.26 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  40.95 
 
 		 445 aa  323  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  34.09 
 
 		 435 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  33.11 
 
 		 434 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  33.94 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  32.16 
 
 		 436 aa  229  6e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  32.81 
 
 		 436 aa  229  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  32.37 
 
 		 445 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  32.29 
 
 		 450 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  32.66 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  30.56 
 
 		 435 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  31.69 
 
 		 436 aa  222  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  33.48 
 
 		 448 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  30.56 
 
 		 436 aa  220  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  31.13 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  32.09 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  31.91 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  32.36 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  32.36 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  32.37 
 
 		 448 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  33.04 
 
 		 448 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  33.04 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  31.46 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  30.56 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  31.13 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  31.24 
 
 		 435 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  33.04 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  31.13 
 
 		 436 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  32.89 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  31.13 
 
 		 436 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  32.59 
 
 		 448 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  32.59 
 
 		 448 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  31.18 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1870  trigger factor  31.43 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359537  normal  0.0257731 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  30.82 
 
 		 437 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  30.82 
 
 		 437 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  30.45 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1537  trigger factor  31.43 
 
 		 447 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  31.52 
 
 		 435 aa  210  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  29.89 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  31.01 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  31.04 
 
 		 448 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  30.68 
 
 		 448 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  29.66 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  29.4 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2118  trigger factor  32.37 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  31.91 
 
 		 434 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  32.59 
 
 		 449 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  32.59 
 
 		 449 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1030  trigger factor  31.91 
 
 		 434 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.553429  hitchhiker  0.0000000130547 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  32.59 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  32.59 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  32.59 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  32.59 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  32.59 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  30.27 
 
 		 437 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1710  trigger factor  30.91 
 
 		 449 aa  206  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  0.0467647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1379  trigger factor  30.75 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  30.82 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  29.02 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  31.35 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>