72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0696 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  327  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  70.13 
 
 		 165 aa  197  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  62.66 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  46.15 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  52.5 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  46.15 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  45.45 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  45.45 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  44.3 
 
 		 155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  44.3 
 
 		 155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  44.81 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  43.87 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  46.84 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  46.84 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  45.96 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  47.41 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  44.52 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  40.62 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  42.77 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  43.23 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  39.62 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  42.77 
 
 		 153 aa  104  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  44.63 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  38.85 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  44.27 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  45.08 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  40 
 
 		 258 aa  91.3  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  33.97 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  39.16 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  47.37 
 
 		 154 aa  87.4  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  35.03 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  36.64 
 
 		 150 aa  84.7  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  44.09 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  44.88 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  37.8 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  46.02 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  41.18 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  37.13 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  37.17 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  44.34 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  37.5 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  36.63 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  35.65 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  35.4 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  33.54 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  39.22 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  35.22 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  33.54 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  37.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  40.43 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  35.53 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479994  hitchhiker  0.00586011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  30.68 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  28.57 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0201  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  24.44 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  32.26 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  34.26 
 
 		 264 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  29.55 
 
 		 266 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  29.38 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  29.38 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0009  thiosulfate-binding protein SoxY  24.36 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.616931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.02 
 
 		 266 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  28.32 
 
 		 280 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0029  thiosulfate-binding protein SoxY  25 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  31.06 
 
 		 288 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  31.67 
 
 		 271 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.67 
 
 		 271 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  33.93 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  30.33 
 
 		 279 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  26.53 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.67 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  30.41 
 
 		 276 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  29 
 
 		 269 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>