More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41030 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  100 
 
 
458 aa  918    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.46 
 
 
449 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  49.02 
 
 
481 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  48.34 
 
 
456 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.12 
 
 
475 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.15 
 
 
471 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.15 
 
 
469 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.72 
 
 
471 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 
486 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  46.62 
 
 
460 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 
478 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 
480 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 
480 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.62 
 
 
461 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.62 
 
 
459 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 
459 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 
488 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  46.44 
 
 
488 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  46.25 
 
 
470 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  45.69 
 
 
466 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  45.69 
 
 
466 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  45.47 
 
 
466 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 
459 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  45.26 
 
 
466 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  45.36 
 
 
487 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  45.26 
 
 
466 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  45.26 
 
 
466 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  45.26 
 
 
466 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
485 aa  355  7.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  41.59 
 
 
459 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
477 aa  354  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
461 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  39.04 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  43.87 
 
 
456 aa  343  5e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  43.21 
 
 
501 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  42.76 
 
 
470 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 
480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  40.18 
 
 
451 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  43.76 
 
 
467 aa  316  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  37.5 
 
 
483 aa  310  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  38.71 
 
 
451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
447 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  38.76 
 
 
456 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  36.9 
 
 
469 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
464 aa  292  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  36.32 
 
 
467 aa  280  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  40.94 
 
 
287 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  38.05 
 
 
830 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.44 
 
 
564 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  33.64 
 
 
564 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  34.91 
 
 
388 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  37.61 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
448 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
450 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  36.2 
 
 
683 aa  124  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
468 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  33.02 
 
 
391 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  36.41 
 
 
515 aa  123  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2783  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
513 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  32.04 
 
 
645 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.76 
 
 
383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
658 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  35.55 
 
 
585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
784 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  35.75 
 
 
482 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  34.3 
 
 
223 aa  120  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
359 aa  120  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  32.42 
 
 
392 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  33.19 
 
 
1101 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  34.06 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  34.06 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  36.64 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  34.76 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  34.76 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  34.76 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
509 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  40.81 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  34.76 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  36.89 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  32.35 
 
 
645 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
662 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  36.73 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  38.5 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  35.06 
 
 
557 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  37.28 
 
 
640 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  38.6 
 
 
662 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
700 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
492 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  36.62 
 
 
463 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  31.9 
 
 
1226 aa  118  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
1229 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  36.97 
 
 
447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>