38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  100 
 
 		 253 aa  491  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22940  CHAD domain-containing protein  56 
 
 		 251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.660754  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  45.56 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4025  CHAD  50 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2251  hypothetical protein  45.16 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  48.41 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1909  CHAD domain-containing protein  45.38 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  hitchhiker  0.00000249861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3462  CHAD domain-containing protein  46.18 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2307  CHAD domain containing protein  45.78 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  44.8 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2282  hypothetical protein  44.8 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  41.06 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1749  CHAD domain-containing protein  47.01 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000731598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  30.36 
 
 		 511 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  30.23 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  29.13 
 
 		 523 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.89 
 
 		 511 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  27.4 
 
 		 523 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  28.02 
 
 		 517 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  29.58 
 
 		 555 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  29.24 
 
 		 318 aa  49.3  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  27.8 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  29.07 
 
 		 513 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  31.41 
 
 		 520 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  27.05 
 
 		 467 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  30.14 
 
 		 519 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  30.99 
 
 		 495 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  30.17 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  30.32 
 
 		 505 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  22.94 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  31.25 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  45.59 
 
 		 543 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2103  CHAD domain containing protein  30.24 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  28.69 
 
 		 505 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  28.23 
 
 		 508 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  24.27 
 
 		 338 aa  42  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  29.54 
 
 		 522 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  36.84 
 
 		 636 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>