230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_13400 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 297 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  70.57 
 
 		 305 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  70.23 
 
 		 303 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  69.02 
 
 		 303 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  68.01 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  65.22 
 
 		 305 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  65.55 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  64.21 
 
 		 305 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  63.64 
 
 		 305 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  61.67 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  61 
 
 		 306 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  34.36 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  31.06 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  35.59 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  33.99 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  29.93 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  32.77 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  32.77 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  32.77 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  32.77 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  36.49 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  32.77 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  35.55 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  37.01 
 
 		 302 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  35.42 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  35.76 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  33.67 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  33.9 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  33.68 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  32.63 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  35.94 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  32.87 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  33.1 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  31.86 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  31.07 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  27.89 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  33.78 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  35.16 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  31.47 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  36.27 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  32.91 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  26.25 
 
 		 312 aa  99.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  27.14 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  31.79 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  33.45 
 
 		 307 aa  95.9  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  30.8 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  26.85 
 
 		 424 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.12 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  29.86 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  37.37 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  30.77 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.55 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  29.29 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.2 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  26.12 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  30.37 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  32.53 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.99 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  30.56 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  28.45 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  30.33 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  31.69 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  26.17 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  21.68 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  24.41 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  24.41 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  24.83 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  24.83 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  25.84 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  24.5 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  24.15 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  24.15 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  24.11 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  30.38 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>