228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10070 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
65 aa  130  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  72.31 
 
 
83 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  76.67 
 
 
65 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  75 
 
 
65 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  63.93 
 
 
65 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  67.74 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  60.66 
 
 
65 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  62.3 
 
 
65 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 
65 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  55.74 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  58.06 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  65.57 
 
 
65 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  59.32 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  56.67 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  57.14 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  46.88 
 
 
66 aa  67  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  55 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  55 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  54.1 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  53.23 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  53.33 
 
 
64 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 
63 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 
63 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  58.18 
 
 
70 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  48.39 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  48.39 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  47.46 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  56.36 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  44.62 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
69 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  55.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  38.46 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 
73 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 
894 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  36.51 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
65 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
70 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  43.08 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  41.27 
 
 
70 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 
62 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  46.03 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  39.06 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  42.37 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  41.27 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
74 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  37.1 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  40.68 
 
 
74 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  44.07 
 
 
111 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
77 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
76 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  44.07 
 
 
111 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  44.07 
 
 
111 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  44.07 
 
 
111 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  44.07 
 
 
111 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  44.07 
 
 
111 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
66 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  38.71 
 
 
68 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  38.71 
 
 
68 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  41.94 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  38.33 
 
 
64 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  44.44 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2074  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2448  heavy metal-binding protein, putative  39.34 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  41.67 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  48.28 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  38.71 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  38.71 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  38.71 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  38.71 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  51.02 
 
 
72 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>