249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04470 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  100 
 
 
266 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.92 
 
 
261 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.27 
 
 
254 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.02 
 
 
258 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.59 
 
 
260 aa  221  8e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.86 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.97 
 
 
260 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.4 
 
 
260 aa  216  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.88 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.46 
 
 
252 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.35 
 
 
268 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.79 
 
 
253 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.41 
 
 
251 aa  202  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.85 
 
 
260 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.74 
 
 
263 aa  192  5e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.26 
 
 
255 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.05 
 
 
249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.22 
 
 
274 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.6 
 
 
261 aa  175  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.65 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.16 
 
 
259 aa  169  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43 
 
 
272 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.39 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.85 
 
 
265 aa  163  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  44.06 
 
 
290 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.61 
 
 
300 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.9 
 
 
258 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  39.2 
 
 
290 aa  145  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  39.73 
 
 
284 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  39.41 
 
 
283 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  38.79 
 
 
268 aa  141  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  39.56 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  43.97 
 
 
223 aa  125  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.38 
 
 
250 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 
250 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.99 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  29.46 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  31.71 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.66 
 
 
250 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.87 
 
 
258 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.33 
 
 
251 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.82 
 
 
274 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
250 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.56 
 
 
250 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.61 
 
 
258 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  33.61 
 
 
324 aa  98.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  30.3 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  31.29 
 
 
325 aa  95.9  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  29.01 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  30.17 
 
 
325 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.27 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.47 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  27.65 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  26.17 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.35 
 
 
252 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  32.35 
 
 
319 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  30.8 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.67 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.28 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.14 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  31.78 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.24 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.24 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.24 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.76 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  31.98 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  34.41 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.62 
 
 
146 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.16 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.57 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  27.91 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.57 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  27.57 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  29.65 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  28.1 
 
 
259 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  30.9 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  56.52 
 
 
212 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.26 
 
 
258 aa  48.9  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3422  septum site-determining protein MinD  49.12 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00479465  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  46.03 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.45 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  27.89 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
400 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.78 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2919  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.502344  hitchhiker  0.000212712 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  23.74 
 
 
347 aa  47.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.85 
 
 
212 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.78 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.41 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  52.17 
 
 
398 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>