213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7549 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  100 
 
 		 363 aa  731    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  74.86 
 
 		 369 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.86 
 
 		 381 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  70.42 
 
 		 378 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.49 
 
 		 363 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  65.28 
 
 		 376 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  63.28 
 
 		 362 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  62.71 
 
 		 362 aa  448  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  63.28 
 
 		 362 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  62.99 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  63.28 
 
 		 362 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  62.99 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  62.99 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  62.71 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.61 
 
 		 369 aa  332  8e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.33 
 
 		 385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.5 
 
 		 365 aa  325  5e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.57 
 
 		 373 aa  325  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  49.21 
 
 		 391 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  51.51 
 
 		 300 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.43 
 
 		 363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  48.2 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  43.1 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  46.7 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  46.93 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.53 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  42.98 
 
 		 371 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.66 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  44.78 
 
 		 360 aa  272  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  45.33 
 
 		 364 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  45.25 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.08 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.26 
 
 		 366 aa  269  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.98 
 
 		 366 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  43.98 
 
 		 366 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  40.72 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.94 
 
 		 366 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  40.44 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.43 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.17 
 
 		 364 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  48.24 
 
 		 395 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.11 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.97 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  44.69 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.66 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.37 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.35 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.43 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  29.94 
 
 		 620 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  31.15 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  30.14 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.8 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.8 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  31.58 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.09 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  30.62 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.86 
 
 		 729 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.62 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.62 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  30.05 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  28.75 
 
 		 853 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  29.73 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  28.22 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  26.78 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  28.78 
 
 		 309 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  30.57 
 
 		 305 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.86 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  27.96 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  28.35 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  30.48 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  27.75 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  28.44 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  31.38 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0683  ATPase  25.95 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.128689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  29.84 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  26.79 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  28.72 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  29.27 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  24.61 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  29.59 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  26.63 
 
 		 345 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.54 
 
 		 291 aa  50.4  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  27.39 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  30.05 
 
 		 298 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.87 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  27.39 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.93 
 
 		 302 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.63 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.72 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2401  ATPase  25.13 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.284187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  30.54 
 
 		 303 aa  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  27.86 
 
 		 743 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  26.75 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  29.56 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  27.37 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.86 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.7 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  26.75 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  26.75 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  26.75 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>