66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1184 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1184  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  239  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0763  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.042345  normal  0.213229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2183  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.21 
 
 		 376 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  43.4 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  32.84 
 
 		 436 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0229  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.790112  hitchhiker  0.00100096 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4444  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  36.47 
 
 		 377 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  32.76 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 312 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  35.71 
 
 		 377 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  29.41 
 
 		 374 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1459  putative transcriptional regulator  36.07 
 
 		 216 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0305  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 86 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 146 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1009  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 170 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  36.21 
 
 		 227 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 364 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4466  helix-turn-helix domain protein  34.43 
 
 		 145 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1494  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  32.89 
 
 		 243 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 380 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  29.41 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  29.41 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  29.41 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  29.27 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0788  transcriptional regulator, Cro/CI family  31.75 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  35.14 
 
 		 377 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  41.51 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1681  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.527285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  31.33 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4120  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 305 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000066786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  26.83 
 
 		 374 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  33.9 
 
 		 245 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4140  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 307 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 361 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  41.51 
 
 		 233 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  41.51 
 
 		 233 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5468  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 174 aa  40  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.624713 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  39.66 
 
 		 229 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 78 aa  40  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  29.58 
 
 		 210 aa  40  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11560  predicted transcriptional regulator  33.87 
 
 		 70 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 82 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  40.74 
 
 		 400 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 272 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>