More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4265 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
125 aa  249  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  80.8 
 
 
125 aa  202  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  60.91 
 
 
119 aa  138  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  51.58 
 
 
130 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4286  transcriptional regulator, ArsR family  48.45 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5816  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 
129 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  47.42 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  46.53 
 
 
135 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  47.78 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  44.9 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2354  transcriptional regulator, ArsR family  56.12 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000229656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
138 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  43.33 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  42.7 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  43.01 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  43.33 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4262  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264931  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  42.22 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  43.33 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  39 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  37.78 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4283  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  39.78 
 
 
221 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  39.18 
 
 
117 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  43.42 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  32.97 
 
 
119 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
173 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
227 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
141 aa  60.1  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
222 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
116 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
120 aa  60.1  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  36.73 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  31.87 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  31.18 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0892  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  40 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  35.37 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  43.06 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
297 aa  58.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  33.71 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 
227 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 
218 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
107 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
107 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>