More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4260 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008539  Arth_4260  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
440 aa  871    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2897  histidinol dehydrogenase  61.02 
 
 
435 aa  471  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3422  histidinol dehydrogenase  59.13 
 
 
440 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10870  histidinol dehydrogenase  58.62 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3192  histidinol dehydrogenase  59.67 
 
 
431 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142432  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1434  histidinol dehydrogenase  59.86 
 
 
440 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3196  histidinol dehydrogenase  57.99 
 
 
456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352835  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2907  Histidinol dehydrogenase  58.28 
 
 
435 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563236  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1150  histidinol dehydrogenase  57.54 
 
 
438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5730  histidinol dehydrogenase  59.11 
 
 
450 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2396  histidinol dehydrogenase  59.36 
 
 
592 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523225  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3242  histidinol dehydrogenase  58.65 
 
 
434 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22650  histidinol dehydrogenase  56.64 
 
 
440 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331856  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3181  histidinol dehydrogenase  61.28 
 
 
443 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584457  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3045  histidinol dehydrogenase  57.24 
 
 
432 aa  438  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2960  histidinol dehydrogenase  57.11 
 
 
441 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.362494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1611  histidinol dehydrogenase  58.94 
 
 
440 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3997  histidinol dehydrogenase  55.56 
 
 
429 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.821981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3079  histidinol dehydrogenase  52.69 
 
 
474 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3613  histidinol dehydrogenase  55 
 
 
449 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3063  histidinol dehydrogenase  52.69 
 
 
474 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.741163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3122  histidinol dehydrogenase  52.69 
 
 
474 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298812  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2804  histidinol dehydrogenase  55.45 
 
 
451 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1302  histidinol dehydrogenase  55.43 
 
 
441 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1089  histidinol dehydrogenase  52.85 
 
 
441 aa  409  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179567  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3163  histidinol dehydrogenase  56.91 
 
 
435 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0133294  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11615  histidinol dehydrogenase  54.27 
 
 
444 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.196616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5722  histidinol dehydrogenase  56.42 
 
 
438 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2023  histidinol dehydrogenase  56.21 
 
 
448 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.908809  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0152  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 
465 aa  404  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1585  histidinol dehydrogenase  54.13 
 
 
458 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1585  histidinol dehydrogenase  54.69 
 
 
458 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3027  histidinol dehydrogenase  54.59 
 
 
431 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0409486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22020  histidinol dehydrogenase  54.92 
 
 
445 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397333  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19310  histidinol dehydrogenase  51.48 
 
 
438 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1916  histidinol dehydrogenase  54.25 
 
 
431 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1058  histidinol dehydrogenase  53.23 
 
 
448 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.540827  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0925  histidinol dehydrogenase  46.21 
 
 
426 aa  309  6.999999999999999e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  44.25 
 
 
422 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  38.27 
 
 
437 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  43.11 
 
 
424 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  36.53 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  34.32 
 
 
428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  37.64 
 
 
427 aa  282  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  45.52 
 
 
430 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  41.38 
 
 
433 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16681  histidinol dehydrogenase  35 
 
 
428 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  36.16 
 
 
428 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  41.08 
 
 
446 aa  279  9e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  37.13 
 
 
434 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  35.66 
 
 
440 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  42.72 
 
 
434 aa  276  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16101  histidinol dehydrogenase  35.59 
 
 
423 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  36.24 
 
 
430 aa  276  7e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1216  histidinol dehydrogenase  37.92 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.755832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0753  histidinol dehydrogenase  43.31 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  39.45 
 
 
427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  36.12 
 
 
428 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2188  histidinol dehydrogenase  36.15 
 
 
430 aa  273  6e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.020326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  38.53 
 
 
429 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  39.8 
 
 
432 aa  272  8.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3563  histidinol dehydrogenase  42.26 
 
 
434 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0867737 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  41.03 
 
 
439 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  39.22 
 
 
442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  33.41 
 
 
424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  38.96 
 
 
430 aa  269  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  41.63 
 
 
426 aa  269  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  42.07 
 
 
435 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  37.21 
 
 
428 aa  268  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  38.53 
 
 
429 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  41.77 
 
 
446 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  38.25 
 
 
426 aa  267  2e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  41.94 
 
 
438 aa  266  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  39.26 
 
 
433 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  41.63 
 
 
434 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  40.39 
 
 
434 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  41.63 
 
 
434 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  35.73 
 
 
449 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  40.32 
 
 
435 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 
457 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18891  histidinol dehydrogenase  35.73 
 
 
449 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  41.13 
 
 
454 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  35.83 
 
 
430 aa  263  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0519  histidinol dehydrogenase  34.58 
 
 
428 aa  263  4e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.538838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 
432 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  41.04 
 
 
432 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2215  histidinol dehydrogenase  41.81 
 
 
438 aa  262  8e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  41.61 
 
 
425 aa  262  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  38.65 
 
 
429 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  38.94 
 
 
425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  41.23 
 
 
436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  43 
 
 
424 aa  259  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0871  histidinol dehydrogenase  39.61 
 
 
441 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  41.5 
 
 
431 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  41.38 
 
 
431 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  37.56 
 
 
441 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  41.3 
 
 
452 aa  257  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  35.78 
 
 
429 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  37.97 
 
 
429 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  38.31 
 
 
442 aa  256  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>