More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1273 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1273  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 507 aa  984    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  50.3 
 
 		 506 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1370  integral membrane protein MviN  50.59 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000411577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  30.78 
 
 		 512 aa  234  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  29.04 
 
 		 523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  28.07 
 
 		 534 aa  191  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  28.04 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  26.97 
 
 		 524 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  26.98 
 
 		 514 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  25.6 
 
 		 523 aa  163  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  23.98 
 
 		 521 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  29.29 
 
 		 495 aa  161  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  24.47 
 
 		 521 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.99 
 
 		 522 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  25.76 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  25.27 
 
 		 526 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  24.78 
 
 		 521 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  25.37 
 
 		 613 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  27.02 
 
 		 525 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  24.89 
 
 		 528 aa  150  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  26.04 
 
 		 529 aa  149  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  26.07 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0885  integral membrane protein MviN  25.29 
 
 		 518 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000255547  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  25.88 
 
 		 531 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  25.19 
 
 		 526 aa  144  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  24.9 
 
 		 522 aa  144  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  24.27 
 
 		 521 aa  143  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  25.11 
 
 		 514 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  24.39 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  24.6 
 
 		 529 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  27.61 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  24.59 
 
 		 511 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1495  integral membrane protein MviN  27.17 
 
 		 497 aa  137  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 		 537 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  24.11 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  25.05 
 
 		 521 aa  137  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  25.72 
 
 		 495 aa  137  6.0000000000000005e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  26.42 
 
 		 556 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  26.04 
 
 		 555 aa  136  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  23.37 
 
 		 511 aa  136  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  26.1 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  25.55 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  25.54 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  25.27 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  25.24 
 
 		 515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  25.05 
 
 		 522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  26.69 
 
 		 529 aa  134  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 		 511 aa  134  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  23.81 
 
 		 505 aa  133  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  24.36 
 
 		 523 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  27.13 
 
 		 494 aa  133  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  25.61 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 		 530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  25.61 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 		 522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  26.37 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  24.2 
 
 		 518 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  21.65 
 
 		 539 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  24.94 
 
 		 512 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  25.24 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  24.54 
 
 		 511 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  22.72 
 
 		 511 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 511 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  24.48 
 
 		 518 aa  129  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  27.01 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  25 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  23.27 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  25.89 
 
 		 512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  24.65 
 
 		 530 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  24.31 
 
 		 522 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  25.05 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  23.33 
 
 		 524 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  23.33 
 
 		 524 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  23.33 
 
 		 524 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  23.33 
 
 		 524 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  23.33 
 
 		 524 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  25.79 
 
 		 548 aa  126  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  24.12 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  24.12 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  24.65 
 
 		 530 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  21.84 
 
 		 531 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  24.41 
 
 		 516 aa  126  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  25.87 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  24.62 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 		 508 aa  124  3e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  24.36 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  23.02 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  22.5 
 
 		 513 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  22.9 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  23.23 
 
 		 535 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>