44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0563 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0563  glycoside hydrolase family 25  100 
 
 		 364 aa  729    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0159511  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1488  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.96 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  29.28 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13500  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  30.5 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 		 628 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0741  endolysin, putative  32.37 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  29.57 
 
 		 592 aa  74.7  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0305  glycoside hydrolase family 25  30 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.655151 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23740  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.47 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.162245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0755  U32 family peptidase  30.19 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2513  glycoside hydrolase family 25  25.76 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  27.18 
 
 		 662 aa  65.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1250  hypothetical protein  28.05 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0611744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1721  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6080  glycoside hydrolase family 25  25.57 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5362  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0600932 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  26.02 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  25.51 
 
 		 342 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  26.02 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0691  glycoside hydrolase family 25  27.49 
 
 		 248 aa  53.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1447  glycosy hydrolase family protein  24.63 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  24.12 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2452  hypothetical protein  24.42 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  26.67 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1403  glycosy hydrolase family protein  24.63 
 
 		 277 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 		 260 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.22 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3899  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496651  normal  0.126944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4267  glycoside hydrolase family 25  24.24 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.720209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4370  glycoside hydrolase family 25  23.74 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.241431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.56 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  21.13 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  21.03 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1615  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.246289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  22.52 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2632  glycoside hydrolase family 25  24.23 
 
 		 268 aa  46.2  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1726  glycoside hydrolase family protein  24.41 
 
 		 277 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4990  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  hitchhiker  0.00324105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2919  glycosyl hydrolase/lysozyme  25.32 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  25.63 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  23.18 
 
 		 265 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  23.12 
 
 		 437 aa  43.1  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  21.74 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>