More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1063 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  39.41 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 245 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  35.74 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  35.55 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  37.71 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 243 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 255 aa  124  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 244 aa  121  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.89 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  28.99 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  30.6 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 284 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  34.47 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.62 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  29.71 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.71 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.71 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  29.71 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 240 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  32.2 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.99 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.99 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5874  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.47 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>