More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1037 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1037  GTPase EngC  100 
 
 		 394 aa  796    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3056  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.25 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.45 
 
 		 324 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.08 
 
 		 367 aa  189  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1836  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2010  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  35.6 
 
 		 349 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2121  ribosome-associated GTPase  35.48 
 
 		 349 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.48 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00740  predicted GTPase  36.47 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1870  ribosome-associated GTPase  34.84 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0794  GTPase EngC  40 
 
 		 358 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.375434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2530  GTPase YjeQ  35.17 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0751  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.84 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.632859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2800  GTPase EngC  35.37 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8124  ribosome-associated GTPase  37.85 
 
 		 360 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3828  ribosome-associated GTPase  34.85 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3723  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.03 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215207  normal  0.348545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2897  ribosome-associated GTPase  35.07 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.6186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0551  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.36 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2785  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.73 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1431  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.43 
 
 		 355 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.65 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6690  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 		 372 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0297  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.46 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000176326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.88 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1820  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.71 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.7 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1021  GTPase EngC  33.02 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.79 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  33.69 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1419  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.27 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.835204  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3135  GTPase EngC  38.34 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2903  GTPase YjeQ  35.33 
 
 		 364 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  33.93 
 
 		 373 aa  152  8.999999999999999e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36680  predicted GTPase  35.99 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  30.67 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.75 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1207  GTPase EngC  33.44 
 
 		 356 aa  149  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0731294 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0036  ribosome-associated GTPase  34.39 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0231  GTPase EngC  36.04 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0241892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4775  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.42 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.31 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1108  GTPase EngC  30.52 
 
 		 353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0320486  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0179  ribosome-associated GTPase  30.06 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1235  ribosome-associated GTPase  31.45 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.435884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2240  GTPase EngC  30.63 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.23 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3340  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.44 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1011  ribosome-associated GTPase  32.51 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  34.69 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3932  GTPase EngC  34.66 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286404  hitchhiker  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1006  GTPase EngC  33.87 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1746  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 		 332 aa  143  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02419  ribosome-associated GTPase  34.49 
 
 		 363 aa  143  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3365  ribosome-associated GTPase  35.36 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  34.36 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1149  GTPase EngC  32.9 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001097  GTPase EngC family protein  32.03 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1673  ribosome-associated GTPase  35.82 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3133  GTPase EngC  36.49 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0595674  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5302  GTPase EngC  33.78 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3240  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.89 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.124299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0386  GTPase EngC  33.44 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3598  GTPase EngC  35.62 
 
 		 348 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.58 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4068  GTPase EngC  35.59 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6175  GTPase EngC  32.41 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.998653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5034  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.03 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237637  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3872  GTPase EngC  31.56 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.202673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1597  GTPase EngC  29.1 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0177073  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3170  ribosome-associated GTPase  30.65 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.519127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.84 
 
 		 349 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.836635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04839  ribosome-associated GTPase  28.71 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.19 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1486  GTPase EngC  29.89 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5544  hypothetical protein  33.56 
 
 		 346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.77 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5285  GTPase EngC  33.58 
 
 		 361 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.4408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  29.33 
 
 		 311 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  28.57 
 
 		 364 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.23 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.39 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  29.82 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  29.5 
 
 		 337 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1285  GTPase EngC  39.86 
 
 		 204 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0396648  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.97 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  29.68 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  30.6 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.75 
 
 		 306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  28.43 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.37 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0380  GTPase EngC  30.82 
 
 		 351 aa  117  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  27.59 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>