More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0072 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 439 aa  916    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  57.05 
 
 		 416 aa  515  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  51.71 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  45.35 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  43.78 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  43.78 
 
 		 391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  39.77 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  40.47 
 
 		 395 aa  324  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  41.53 
 
 		 389 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  40.7 
 
 		 418 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  40.7 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  38.05 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  42.46 
 
 		 392 aa  297  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  39.44 
 
 		 394 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  37.12 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  36.83 
 
 		 391 aa  275  8e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  37.88 
 
 		 413 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  37.38 
 
 		 391 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  36.26 
 
 		 396 aa  265  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  36.78 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  36.97 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  37.2 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  37.02 
 
 		 396 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  36.49 
 
 		 396 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  36.19 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  35.27 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  36.78 
 
 		 396 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  36.26 
 
 		 396 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  37.26 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  37.26 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  37.26 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  38.37 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  36.41 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  34.64 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  34.43 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  35.2 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  35.61 
 
 		 394 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  38.43 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  34.57 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  35.75 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  34.72 
 
 		 396 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  34.72 
 
 		 396 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  35.42 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  34.49 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  34.72 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  34.72 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  36.28 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  34.72 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  34.88 
 
 		 391 aa  240  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  32.33 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  35.75 
 
 		 404 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  35.51 
 
 		 404 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  33.56 
 
 		 396 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  35.58 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  33.8 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  35.1 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  34.03 
 
 		 396 aa  239  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  34.03 
 
 		 396 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  34.7 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  34.1 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  34.1 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  35.21 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  34.62 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  34.1 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  34.1 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  34.1 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  34.87 
 
 		 397 aa  237  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  35.48 
 
 		 392 aa  236  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  35.27 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  35.14 
 
 		 395 aa  236  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  35.05 
 
 		 404 aa  235  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  36.28 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  35.05 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  35.05 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  35.05 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  34.2 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  30.93 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  34.8 
 
 		 388 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  34.52 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  34.1 
 
 		 397 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  35.94 
 
 		 408 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  35.61 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  33.87 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  33.87 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  33.48 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  33.26 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  34.2 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  33.8 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  33.41 
 
 		 393 aa  226  7e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  33.18 
 
 		 423 aa  226  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2179  methyltransferase small  34.27 
 
 		 393 aa  226  9e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.41478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  33.41 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  34.02 
 
 		 418 aa  223  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  32.96 
 
 		 408 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  33.49 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  32.86 
 
 		 388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  35.1 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  35.1 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  34.02 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  34.7 
 
 		 394 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>