More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2049 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  100 
 
 		 596 aa  1203    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  43.68 
 
 		 595 aa  505  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  36.03 
 
 		 628 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.95 
 
 		 579 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.95 
 
 		 579 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.95 
 
 		 579 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  36.03 
 
 		 636 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.78 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.3 
 
 		 591 aa  307  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.14 
 
 		 593 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.14 
 
 		 593 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.68 
 
 		 589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.68 
 
 		 589 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.68 
 
 		 589 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.73 
 
 		 591 aa  297  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.47 
 
 		 591 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.04 
 
 		 577 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  35.08 
 
 		 589 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  33.92 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  33.92 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.82 
 
 		 461 aa  224  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.91 
 
 		 560 aa  191  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0516  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.19 
 
 		 601 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132092  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  32.95 
 
 		 471 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.83 
 
 		 614 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.4 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.86 
 
 		 426 aa  156  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.4 
 
 		 426 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  25.04 
 
 		 608 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  26.58 
 
 		 615 aa  150  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  25.09 
 
 		 613 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  26.55 
 
 		 625 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.66 
 
 		 470 aa  146  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  25.65 
 
 		 627 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  23.61 
 
 		 631 aa  144  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.69 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.93 
 
 		 620 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  30.5 
 
 		 595 aa  138  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  24.67 
 
 		 584 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  26.12 
 
 		 624 aa  138  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  25.49 
 
 		 627 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  29.85 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  24.2 
 
 		 617 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.49 
 
 		 587 aa  134  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  28.85 
 
 		 626 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  30.45 
 
 		 575 aa  130  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  28.51 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  23.87 
 
 		 604 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.31 
 
 		 669 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  26.03 
 
 		 628 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.67 
 
 		 594 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  24.91 
 
 		 602 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  27.17 
 
 		 605 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  32 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  25.83 
 
 		 863 aa  123  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  25.65 
 
 		 579 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  26.97 
 
 		 605 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  26.47 
 
 		 597 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  25.41 
 
 		 603 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  25.35 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  26.63 
 
 		 564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.76 
 
 		 582 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.21 
 
 		 580 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.03 
 
 		 754 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  27.96 
 
 		 589 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  27.96 
 
 		 589 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  25.99 
 
 		 544 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  31.85 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  26.27 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  25.38 
 
 		 603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.14 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  28.29 
 
 		 586 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  28.51 
 
 		 595 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  30.17 
 
 		 859 aa  118  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  27.6 
 
 		 600 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  26.44 
 
 		 598 aa  117  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1607  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.32 
 
 		 418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  28.61 
 
 		 577 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1666  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 		 418 aa  114  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  29.46 
 
 		 629 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  26.02 
 
 		 600 aa  114  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01561  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 		 418 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2051  Chloride channel core  30.03 
 
 		 418 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1800  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 		 418 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01551  hypothetical protein  30.03 
 
 		 418 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  26.35 
 
 		 605 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2038  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 		 418 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.22 
 
 		 569 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  27.16 
 
 		 584 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2303  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 		 418 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0264865 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.08 
 
 		 585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1779  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.03 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  28.46 
 
 		 599 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  27.4 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  27.1 
 
 		 637 aa  112  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.55 
 
 		 598 aa  112  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  26.14 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  25.33 
 
 		 582 aa  110  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  24.96 
 
 		 603 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  29.39 
 
 		 598 aa  110  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>