More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1535 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1535  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 390 aa  803    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.442793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1741  tryptophan synthase subunit beta  75.13 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2467  tryptophan synthase subunit beta  75.91 
 
 		 395 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1588  tryptophan synthase subunit beta  73.2 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00363039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3479  tryptophan synthase subunit beta  69.69 
 
 		 387 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0124  tryptophan synthase subunit beta  62.3 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  60.57 
 
 		 409 aa  476  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 418 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  58.79 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0695  tryptophan synthase subunit beta  58.66 
 
 		 401 aa  461  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 403 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 409 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 399 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 399 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  56.88 
 
 		 394 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  59.21 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  60.85 
 
 		 405 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  58.66 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  57.73 
 
 		 414 aa  454  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1790  tryptophan synthase subunit beta  58.76 
 
 		 391 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  60.85 
 
 		 389 aa  455  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  56.36 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.85 
 
 		 389 aa  455  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  57.83 
 
 		 442 aa  451  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  56.36 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  58.99 
 
 		 403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  59.48 
 
 		 394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  57.96 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 422 aa  448  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  55.84 
 
 		 394 aa  448  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 		 410 aa  448  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  56.33 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  58.9 
 
 		 391 aa  450  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  55.47 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  59.43 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  57.96 
 
 		 402 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 406 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 410 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 401 aa  448  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 410 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1253  bifunctional phosphoribosylanthranilate isomerase/tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 600 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.562305  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  58.53 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  58.53 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  56.7 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  56.36 
 
 		 401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0839  tryptophan synthase, beta subunit  54.66 
 
 		 401 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  57.81 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1306  bifunctional phosphoribosylanthranilate isomerase/tryptophan synthase subunit beta  57.92 
 
 		 600 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  56.4 
 
 		 399 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 409 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1394  tryptophan synthase subunit beta  56.88 
 
 		 392 aa  444  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000239329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 406 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  56.19 
 
 		 397 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  54.85 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 406 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  58.03 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 		 418 aa  441  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  57.94 
 
 		 404 aa  441  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  55.22 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 404 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  57.72 
 
 		 433 aa  441  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  55.22 
 
 		 414 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 420 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  59.95 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  59.17 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  58.4 
 
 		 420 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  56.19 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 406 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  58.22 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  57.36 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 404 aa  438  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  56.66 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0076  tryptophan synthase subunit beta  58.38 
 
 		 390 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  59.17 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 420 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1433  tryptophan synthase subunit beta  54.29 
 
 		 404 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>