247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5303 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5303  oxidoreductase  100 
 
 		 463 aa  940    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0884  putative short chain dehydrogenase  65.19 
 
 		 570 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00530  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  68.74 
 
 		 482 aa  673    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4441  putative short chain dehydrogenase  72.36 
 
 		 474 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2139  putative short chain dehydrogenase  65.06 
 
 		 483 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.538588  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1886  putative oxidoreductase  65.21 
 
 		 483 aa  630  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334435 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0270  putative short chain dehydrogenase  68.25 
 
 		 503 aa  622  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0850168  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1055  oxidoreductase  63.91 
 
 		 507 aa  620  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.730863  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4871  putative short chain dehydrogenase  65.97 
 
 		 495 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00534901  normal  0.736841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1517  oxidoreductase  69.58 
 
 		 492 aa  603  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 		 485 aa  597  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1920  putative short chain dehydrogenase  71.82 
 
 		 500 aa  592  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00730  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  62.42 
 
 		 529 aa  580  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7573  putative short chain dehydrogenase  50.86 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2398  oxidoreductase  55.09 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4251  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  56.99 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.044314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04190  oxidoreductase  42.28 
 
 		 527 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10158  short-chain dehydrogenase  41.75 
 
 		 509 aa  286  5e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44390  predicted protein  41.59 
 
 		 433 aa  283  6.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1626  oxidoreductase  45.06 
 
 		 539 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498473  normal  0.638708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2199  oxidoreductase  45.48 
 
 		 539 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0323008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1749  oxidoreductase  38.46 
 
 		 535 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0726127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1678  oxidoreductase  44.72 
 
 		 538 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00133842  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45855  predicted protein  39.6 
 
 		 650 aa  166  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.306932  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  41.24 
 
 		 254 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 268 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152096  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 238 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  43.62 
 
 		 255 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 286 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 314 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 240 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 227 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 286 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 247 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 264 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 		 255 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 328 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2394  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 268 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.097477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 247 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 289 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 		 254 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 256 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  36.13 
 
 		 258 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 341 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.8 
 
 		 251 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 		 265 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.11 
 
 		 246 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 255 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  33.68 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 255 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 246 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  35.78 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 258 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 292 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 246 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 301 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.62 
 
 		 257 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 		 254 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 		 293 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  33.68 
 
 		 267 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 256 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.58 
 
 		 285 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 277 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.77 
 
 		 306 aa  47.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 298 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 264 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 246 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  36.46 
 
 		 254 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0221  UDP-galactose 4-epimerase  26.39 
 
 		 347 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.000600389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 294 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1106  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 256 aa  47.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179926  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 333 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752467  normal  0.0103168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 331 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 265 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 248 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36 
 
 		 249 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 257 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.46 
 
 		 261 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 265 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 241 aa  47  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 257 aa  47  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 266 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 246 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 265 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 300 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4704  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 265 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000843868  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05091  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36 
 
 		 249 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 		 275 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0283  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.07 
 
 		 250 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000106623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1477  beta keto-acyl synthase  34 
 
 		 2273 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 246 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2849  glucose 1-dehydrogenase  37.04 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.14 
 
 		 249 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 292 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>