More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4084 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 
394 aa  791    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  64.47 
 
 
394 aa  511  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.4 
 
 
390 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  57.03 
 
 
393 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  56.35 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  54.34 
 
 
392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.01 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.76 
 
 
395 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.86 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.21 
 
 
418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  32.61 
 
 
402 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.24 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  35.2 
 
 
636 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  31.18 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.33 
 
 
421 aa  170  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  32.61 
 
 
405 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.8 
 
 
390 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.39 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.35 
 
 
390 aa  163  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.75 
 
 
394 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.75 
 
 
394 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.75 
 
 
394 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  30.89 
 
 
387 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.11 
 
 
399 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.89 
 
 
387 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.17 
 
 
394 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  30.43 
 
 
427 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.89 
 
 
387 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.71 
 
 
390 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.71 
 
 
390 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.83 
 
 
388 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.37 
 
 
388 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.5 
 
 
394 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  30.29 
 
 
427 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.31 
 
 
389 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.65 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  29.38 
 
 
468 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.42 
 
 
389 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.54 
 
 
433 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  30.3 
 
 
415 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  29.44 
 
 
394 aa  150  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.72 
 
 
392 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.72 
 
 
392 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.72 
 
 
392 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.96 
 
 
404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.14 
 
 
394 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  28.09 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  29.17 
 
 
433 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  31.77 
 
 
409 aa  145  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.11 
 
 
407 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.3 
 
 
392 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  27.61 
 
 
389 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.58 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.96 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  26.87 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.21 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.78 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.37 
 
 
397 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.41 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.31 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.77 
 
 
393 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  26.6 
 
 
413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.52 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.52 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.93 
 
 
398 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.51 
 
 
404 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.39 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.04 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.72 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.64 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.04 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.18 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.24 
 
 
397 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.64 
 
 
397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.41 
 
 
397 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.05 
 
 
399 aa  126  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4068  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.63 
 
 
434 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717814  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.71 
 
 
386 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  28.86 
 
 
405 aa  123  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.66 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.58 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.85 
 
 
400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  29.5 
 
 
409 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.99 
 
 
386 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  25.58 
 
 
393 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.57 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.47 
 
 
396 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.49 
 
 
391 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.02 
 
 
389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  31.62 
 
 
370 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  30.57 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  29.47 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.65 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0705  putative oxidoreductase, MmfH  25.34 
 
 
385 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202929  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  26.82 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.5 
 
 
413 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.93 
 
 
391 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.41 
 
 
370 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.59 
 
 
391 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.59 
 
 
391 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.158031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>