More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2324 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  100 
 
 		 144 aa  282  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  58.33 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  51.08 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  50.71 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  56.78 
 
 		 140 aa  130  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  48.53 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  55.88 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  42.54 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  45.59 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  37.76 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  43.33 
 
 		 170 aa  95.5  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  42.86 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  41.01 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  39.53 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  36.64 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0213  CheW protein  50.89 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178938  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  40 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.11 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  36.64 
 
 		 163 aa  93.6  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  39.86 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  42.42 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.35 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  35.11 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  42.03 
 
 		 166 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  42.03 
 
 		 166 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  34.35 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  34.35 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  34.35 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  35.11 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  34.35 
 
 		 164 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  34.35 
 
 		 163 aa  90.1  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  34.35 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  34.35 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  34.35 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  34.35 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  33.59 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  34.35 
 
 		 161 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34.35 
 
 		 164 aa  88.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  34.35 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.11 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  35.11 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  35.11 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  35.11 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  37.69 
 
 		 169 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  39.69 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  34.35 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  39.84 
 
 		 159 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  34.35 
 
 		 159 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  34.35 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  37.41 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  38.41 
 
 		 159 aa  87  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  33.59 
 
 		 164 aa  86.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  38.41 
 
 		 159 aa  87  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  37.69 
 
 		 169 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.35 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.59 
 
 		 174 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  31.82 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  38.28 
 
 		 167 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.61 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  32.82 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.61 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  32.82 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  34.35 
 
 		 165 aa  84.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  34.85 
 
 		 163 aa  84.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  32.12 
 
 		 253 aa  84.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  40.74 
 
 		 172 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  32.82 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  32.06 
 
 		 163 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  37.29 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  34.62 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  34.75 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  34.35 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  34.75 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  33.59 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  35.97 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  37.21 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  33.9 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  31.69 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  31.69 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  31.69 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  31.69 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  31.69 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  31.69 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  34.09 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  31.69 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  32.09 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  31.75 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.01 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  32.82 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  34.59 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  33.1 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  30 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  30.99 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  33.07 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.03 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  30 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  35.34 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  29.46 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  27.54 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  33.59 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>