More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1676 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1676  ribosomal protein L20  100 
 
 		 122 aa  238  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.021642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  68.42 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  65.22 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  65.22 
 
 		 117 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  65.22 
 
 		 128 aa  149  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  66.67 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  61.21 
 
 		 125 aa  148  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  64.55 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1105  ribosomal protein L20  66.09 
 
 		 128 aa  147  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0771886  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  64.6 
 
 		 121 aa  146  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  63.48 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  62.61 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 123 aa  144  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  63.48 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  62.5 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 120 aa  143  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  62.07 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1626  ribosomal protein L20  65.22 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.75849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2064  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0330135  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 129 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3037  ribosomal protein L20  61.82 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.206291  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 129 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 129 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 127 aa  139  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05740  LSU ribosomal protein L20P  65.49 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000012199  normal  0.0122872 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  61.4 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1730  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00695308  hitchhiker  0.00143351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1877  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1482  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4142  ribosomal protein L20  60.18 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000151582  hitchhiker  0.000263316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1479  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0477  ribosomal protein L20  63.21 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1884  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0962334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14570  LSU ribosomal protein L20P  58.41 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  58.41 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  54.39 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2355  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.030925  normal  0.100889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3540  50S ribosomal protein L20  62 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0376723  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2846  ribosomal protein L20  62.83 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  59.63 
 
 		 119 aa  126  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  56.14 
 
 		 115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 119 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 119 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3522  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  52.63 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  51.3 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0536  ribosomal protein L20  64.66 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00112168  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  53.51 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0524  ribosomal protein L20  54.39 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000408752  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  53.04 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  61.47 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  55.26 
 
 		 118 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  52.68 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  54.46 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>