More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2355 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2355  50S ribosomal protein L20  100 
 
 
127 aa  253  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.030925  normal  0.100889 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1557  50S ribosomal protein L20  60.63 
 
 
127 aa  140  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 
118 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 
119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 
118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  56.67 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
119 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  55.37 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 
115 aa  131  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 
119 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
119 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  59.43 
 
 
119 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  58.12 
 
 
117 aa  130  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 
117 aa  130  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 
117 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
119 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
119 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  56.78 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  53.72 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1676  ribosomal protein L20  55.28 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.021642  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  52.76 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  56.9 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  56.41 
 
 
117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4142  ribosomal protein L20  54.62 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000151582  hitchhiker  0.000263316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 
118 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
118 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 
117 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 
118 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14570  LSU ribosomal protein L20P  52.14 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 
117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  127  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  58.49 
 
 
119 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  51.61 
 
 
124 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0536  ribosomal protein L20  61.54 
 
 
118 aa  127  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00112168  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
118 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  126  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
118 aa  126  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
118 aa  126  9.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  52.54 
 
 
118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  52.99 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  55.56 
 
 
118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  55.75 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  55 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
119 aa  124  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 
118 aa  124  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 
117 aa  124  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  52.99 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0084  ribosomal protein L20  52.99 
 
 
117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000355513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  53.39 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  49.6 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0524  ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  124  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000408752  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
118 aa  123  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
118 aa  123  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
118 aa  123  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
118 aa  123  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
118 aa  123  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
118 aa  123  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
118 aa  123  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
118 aa  123  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
118 aa  123  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  52.99 
 
 
119 aa  123  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  59.43 
 
 
117 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  59.43 
 
 
117 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  53.85 
 
 
118 aa  123  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  60.78 
 
 
119 aa  122  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  52.14 
 
 
117 aa  122  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
118 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 
119 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  52.25 
 
 
163 aa  122  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  52.63 
 
 
129 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
119 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>