More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1595 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 192 aa  375  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  46.03 
 
 		 192 aa  157  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 190 aa  157  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  45.11 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  50.54 
 
 		 197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 		 192 aa  154  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  50.56 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  47.57 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  43.33 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  46.77 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  46.77 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  43.33 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  44.25 
 
 		 211 aa  144  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  44.25 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  36.56 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  45.29 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  41.11 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 201 aa  140  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  45.81 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  41.95 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  36.22 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  34.1 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  35.68 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  45.14 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  36.61 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 183 aa  138  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 		 189 aa  137  7e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 188 aa  137  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  34.78 
 
 		 186 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 		 189 aa  137  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  35.14 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  42.35 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  50.34 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  41.95 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 213 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.27 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0339  peptidyl-tRNA hydrolase  38.89 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  39.36 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  47.62 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  44.68 
 
 		 199 aa  131  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  48.13 
 
 		 191 aa  131  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  33.16 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.92 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  40.2 
 
 		 201 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  40.2 
 
 		 201 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2002  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 191 aa  130  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000950894  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  38.5 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  35.33 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.02 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  38.92 
 
 		 193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.79 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  49.16 
 
 		 199 aa  127  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7303  predicted protein  41.49 
 
 		 189 aa  127  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00433512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  45.62 
 
 		 203 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0393  peptidyl-tRNA hydrolase  43.94 
 
 		 217 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  39.89 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  35.26 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.37 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  35.23 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  37.95 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>