More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1373 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1373  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.531782  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20200  Enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
264 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.69 
 
 
263 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.14 
 
 
659 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
266 aa  139  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 
263 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.74 
 
 
662 aa  137  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
270 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
263 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
280 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
264 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
257 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
264 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.25 
 
 
264 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  34.21 
 
 
663 aa  135  8e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
259 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 
263 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.62 
 
 
651 aa  135  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.25 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.98 
 
 
662 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
263 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
263 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
254 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.71 
 
 
662 aa  126  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
263 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
261 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  29.12 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
266 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
263 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
255 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.96 
 
 
255 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3213  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
260 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.79 
 
 
661 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.59 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.96 
 
 
255 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.58 
 
 
255 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.03 
 
 
262 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
264 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.12 
 
 
265 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.94 
 
 
257 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  33.99 
 
 
266 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
276 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
251 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
263 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
266 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
258 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
263 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
258 aa  122  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2902  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  34.66 
 
 
650 aa  121  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  28.92 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  31.01 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  36.12 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 
267 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
260 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
266 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 
267 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
261 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 
260 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
266 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
263 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
260 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2750  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2959  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
260 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
263 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
263 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>