More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0779 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0779  inner-membrane translocator  100 
 
 		 336 aa  643    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2203  inner-membrane translocator  50.87 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 331 aa  116  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 328 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 326 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  30.14 
 
 		 603 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1906  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 326 aa  109  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 562 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  28.05 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 335 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  32 
 
 		 407 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2167  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0908  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.579851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  30.32 
 
 		 663 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 393 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  29.85 
 
 		 343 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 337 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 337 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0794  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  30.26 
 
 		 643 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5446  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  30.97 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1308  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.06 
 
 		 620 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832531  normal  0.97267 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2919  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.16 
 
 		 646 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  29.37 
 
 		 646 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 637 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.27 
 
 		 328 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  27.88 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 571 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 389 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.23 
 
 		 609 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.43 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.43 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  30.57 
 
 		 643 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.43 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3966  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  30.77 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.43 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.43 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.43 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.79 
 
 		 350 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 389 aa  93.6  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.11 
 
 		 389 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.43 
 
 		 389 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 389 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  31.44 
 
 		 606 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7433  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  29.89 
 
 		 363 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1067  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0499919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  29 
 
 		 407 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 300 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  29.39 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 315 aa  92.8  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 389 aa  92.4  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 463 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1135  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1532  inner-membrane translocator  30.31 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1437  inner-membrane translocator  30.31 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2015  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.60727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  28.05 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>