54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3595 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3736  hypothetical protein  81.26 
 
 
505 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0978251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3595  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1040    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3662  hypothetical protein  77.48 
 
 
503 aa  730    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3596  hypothetical protein  55.74 
 
 
498 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3717  hypothetical protein  51.88 
 
 
559 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.912056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4392  tetratricopeptide TPR_4  41.02 
 
 
498 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0572051  normal  0.357781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1900  hypothetical protein  40.25 
 
 
506 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1959  hypothetical protein  38.57 
 
 
488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159459  normal  0.917261 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2064  hypothetical protein  38.28 
 
 
504 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1979  hypothetical protein  39.66 
 
 
507 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0380976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3737  hypothetical protein  62.5 
 
 
219 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2862  hypothetical protein  26.69 
 
 
590 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247941  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0022  hypothetical protein  25.37 
 
 
529 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575522  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  31.25 
 
 
587 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  31.25 
 
 
545 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
3560 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.88 
 
 
359 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  33.56 
 
 
503 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.69 
 
 
810 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0618  hypothetical protein  24.67 
 
 
325 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 
927 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
708 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
366 aa  47.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  30.26 
 
 
648 aa  47.4  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.91 
 
 
622 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
448 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
811 aa  47  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
878 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 
293 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
740 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.37 
 
 
1013 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  32.12 
 
 
475 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
583 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
465 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  31.17 
 
 
540 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
471 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.5 
 
 
560 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 
375 aa  45.4  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
654 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2280  hypothetical protein  30.32 
 
 
514 aa  45.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.14 
 
 
465 aa  45.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2275  hypothetical protein  33.33 
 
 
342 aa  44.3  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0699286  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
520 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  35.92 
 
 
725 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
505 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.52 
 
 
725 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.75 
 
 
764 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
465 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.85 
 
 
673 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
935 aa  43.5  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_510  hypothetical protein  31.58 
 
 
408 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2230  hypothetical protein  28.19 
 
 
387 aa  43.5  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
468 aa  43.5  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>