73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2894 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
159 aa  320  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  96.23 
 
 
159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  96.86 
 
 
159 aa  310  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  55.26 
 
 
161 aa  177  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  53.9 
 
 
161 aa  174  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  57.14 
 
 
160 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  55.77 
 
 
159 aa  164  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  55 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55 
 
 
160 aa  159  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  48.08 
 
 
157 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  52.5 
 
 
157 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  59.52 
 
 
129 aa  142  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.02 
 
 
156 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  48.75 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  46.45 
 
 
155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  47.02 
 
 
153 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.03 
 
 
152 aa  110  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  42.68 
 
 
154 aa  97.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  44.74 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  37.62 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.61 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.62 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  38.61 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  35.2 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  35.24 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  35.77 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  35.25 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  35.25 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  35.25 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  40.38 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  30.3 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  38.61 
 
 
154 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  37.62 
 
 
155 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  34.82 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  31.09 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  33.61 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  36.63 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.83 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  32.35 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.83 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 
333 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  30.83 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  33.03 
 
 
170 aa  57.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  34.65 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  36.27 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  36.44 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.37 
 
 
332 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.77 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  31.68 
 
 
160 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  32.67 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  31.68 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  31.68 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  31.68 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.3 
 
 
172 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  31.68 
 
 
153 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  31.68 
 
 
153 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  31.78 
 
 
171 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.3 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  28.95 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  29.9 
 
 
332 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.08 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  26.56 
 
 
171 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 
187 aa  40.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>