More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2533 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  54 
 
 
594 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1418  aspartyl-tRNA synthetase  98.84 
 
 
603 aa  1228    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
598 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 
594 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2533  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
603 aa  1243    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 
593 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
618 aa  677    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1329  aspartyl-tRNA synthetase  90.03 
 
 
616 aa  1149    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519796  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 
593 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1316  aspartyl-tRNA synthetase  98.51 
 
 
603 aa  1224    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 
594 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 
593 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
596 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
592 aa  627  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 
606 aa  616  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
627 aa  618  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
597 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
610 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
594 aa  611  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
600 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
614 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
598 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
585 aa  601  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 
619 aa  600  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 
613 aa  595  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
602 aa  597  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
595 aa  592  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
590 aa  594  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
593 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
598 aa  587  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
607 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
597 aa  581  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
597 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
592 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
589 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
594 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
590 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
599 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0582  aspartyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
599 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
591 aa  568  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
591 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
591 aa  568  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
591 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
591 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
591 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
597 aa  568  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
608 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
591 aa  568  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
591 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
602 aa  568  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
594 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
597 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
591 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
601 aa  566  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
589 aa  564  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
605 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
623 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
600 aa  565  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
592 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
599 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
599 aa  558  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
617 aa  559  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  48 
 
 
599 aa  555  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
592 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
595 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
594 aa  556  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
600 aa  557  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
602 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
599 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
597 aa  551  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
594 aa  553  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
591 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 
586 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
600 aa  553  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
588 aa  550  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
600 aa  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
593 aa  549  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
590 aa  551  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
600 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
588 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
602 aa  551  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
587 aa  550  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
588 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
600 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
592 aa  547  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
600 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
600 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
600 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
593 aa  545  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
600 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
600 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
601 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
599 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
600 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
600 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
600 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
589 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>