More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1822 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.31 
 
 
481 aa  753    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
484 aa  953    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  97.31 
 
 
484 aa  933    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  97.11 
 
 
484 aa  931    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.46 
 
 
470 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 
475 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.13 
 
 
470 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.13 
 
 
470 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.13 
 
 
470 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.6 
 
 
470 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.13 
 
 
470 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.13 
 
 
470 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.04 
 
 
475 aa  418  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.13 
 
 
470 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.35 
 
 
470 aa  422  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.92 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.48 
 
 
470 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.92 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.92 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.4 
 
 
616 aa  410  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.87 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.52 
 
 
492 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.68 
 
 
468 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.82 
 
 
491 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.52 
 
 
470 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.66 
 
 
464 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.04 
 
 
467 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.47 
 
 
468 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.47 
 
 
468 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.44 
 
 
472 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.18 
 
 
607 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.94 
 
 
479 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.15 
 
 
593 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.78 
 
 
625 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.1 
 
 
472 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  45.34 
 
 
472 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.92 
 
 
599 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.13 
 
 
470 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.96 
 
 
459 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.25 
 
 
619 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 
480 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.65 
 
 
477 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.54 
 
 
680 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.81 
 
 
602 aa  364  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.61 
 
 
603 aa  364  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.39 
 
 
603 aa  363  3e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 
481 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.9 
 
 
476 aa  362  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.23 
 
 
480 aa  358  9e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
467 aa  358  9e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.25 
 
 
463 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
475 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 
467 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.34 
 
 
475 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.21 
 
 
473 aa  358  9.999999999999999e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.31 
 
 
475 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.34 
 
 
475 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.92 
 
 
467 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.34 
 
 
475 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
474 aa  356  6.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 
466 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.09 
 
 
475 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.88 
 
 
475 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.28 
 
 
475 aa  354  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.88 
 
 
475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.88 
 
 
475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0321  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.68 
 
 
476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0683294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3415  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
475 aa  353  4e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000233503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.19 
 
 
478 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
476 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
478 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  42.58 
 
 
466 aa  352  7e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
478 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.01 
 
 
467 aa  351  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.98 
 
 
475 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3002  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  44.84 
 
 
473 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
471 aa  351  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.14 
 
 
478 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.14 
 
 
478 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.23 
 
 
467 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.37 
 
 
471 aa  350  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.41 
 
 
483 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 
478 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.81 
 
 
468 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.15 
 
 
467 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.33 
 
 
467 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.1 
 
 
579 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 
593 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.61 
 
 
467 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.52 
 
 
470 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.67 
 
 
588 aa  348  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.21 
 
 
466 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.38 
 
 
466 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 
467 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.28 
 
 
474 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.23 
 
 
462 aa  346  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.53 
 
 
477 aa  346  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
478 aa  346  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.4 
 
 
467 aa  346  6e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.28 
 
 
474 aa  346  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>