More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1590 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
174 aa  344  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  98.28 
 
 
174 aa  339  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  97.13 
 
 
174 aa  335  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  85.06 
 
 
174 aa  308  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  43.64 
 
 
172 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  39.05 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 
174 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  41.18 
 
 
170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  38.37 
 
 
174 aa  124  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  39.62 
 
 
174 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  39.77 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  41.82 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  37.34 
 
 
173 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  37.34 
 
 
173 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  38.61 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  41.82 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  39.62 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  38.89 
 
 
166 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  38.1 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  37.43 
 
 
172 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  38.37 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  38.36 
 
 
174 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
172 aa  111  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 
171 aa  111  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 
172 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  37.33 
 
 
165 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 
194 aa  110  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  37.21 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  37.33 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  38.89 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  39.61 
 
 
174 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  37.36 
 
 
172 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 
168 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  42.21 
 
 
183 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 
166 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  39.39 
 
 
174 aa  107  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
166 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  36.6 
 
 
179 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 
181 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 
174 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  35.95 
 
 
215 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 
176 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 
195 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 
170 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 
174 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  36 
 
 
175 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  34.12 
 
 
181 aa  104  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  36.24 
 
 
178 aa  104  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 
172 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 
173 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 
168 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 
168 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 
172 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 
166 aa  102  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 
172 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 
175 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
173 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  33.55 
 
 
166 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  33.55 
 
 
166 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 
173 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  36.88 
 
 
171 aa  101  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 
176 aa  101  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 
172 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 
172 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 
172 aa  100  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  40.88 
 
 
172 aa  100  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  35.5 
 
 
171 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  32.54 
 
 
174 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 
172 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 
172 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  32.54 
 
 
174 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  32.74 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  34.34 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  34.12 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  38.35 
 
 
166 aa  99  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>