48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0385 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 376 aa  775    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  72.39 
 
 		 376 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  66.4 
 
 		 376 aa  534  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  66.49 
 
 		 376 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  64.63 
 
 		 376 aa  522  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  64.08 
 
 		 375 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  62.57 
 
 		 375 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  40.54 
 
 		 368 aa  279  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  40 
 
 		 368 aa  269  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  39.25 
 
 		 368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  28.38 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  28.65 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  27.4 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.5 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  26.44 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.92 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  29.44 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.56 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  29.91 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  26.77 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  26.09 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  22.78 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  25.96 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  23.61 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  22.78 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.43 
 
 		 659 aa  63.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  26 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.61 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  26.47 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  25.21 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  23.15 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  25.57 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  22.69 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  26.15 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  27.18 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.46 
 
 		 646 aa  58.9  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  23.41 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  22.48 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  28.78 
 
 		 670 aa  53.5  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  22.55 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  23.59 
 
 		 365 aa  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  23.58 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  21.58 
 
 		 612 aa  46.6  0.0007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.8 
 
 		 609 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.8 
 
 		 609 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.8 
 
 		 609 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  28.8 
 
 		 1478 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>