73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0259 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0259  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  100 
 
 		 153 aa  322  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0185  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  56.67 
 
 		 158 aa  179  9.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5 epimerase  53.9 
 
 		 158 aa  173  8e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.930193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0165  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related  51.33 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0055  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  50.33 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1213  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzyme  45.03 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2142  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  43.14 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1887  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  39.87 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394283  normal  0.415914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4813  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  37.67 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841507  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3931  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  40.82 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2887  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  39.6 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1910  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  39.04 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3696  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  37.67 
 
 		 173 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1258  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  34.01 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0875  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  36.6 
 
 		 165 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2463  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  39.29 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1754  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  39.29 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1352  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  33.33 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2082  hypothetical protein  38.46 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2215  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.71 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0925  hypothetical protein  35.38 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.540819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2861  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  36.92 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000254374  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1604  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  29.45 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.679828  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2752  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related protein  33.1 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.711856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0540  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  31.85 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2030  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase  34.29 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2655  hypothetical protein  25.34 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1571  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.58 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 372 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0160035  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1539  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.62 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.731559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2560  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.05 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00989  dTDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose-3,6-epimerase  27.54 
 
 		 181 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 364 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1988  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.32 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1490  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.32 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4207  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.68 
 
 		 184 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.653218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0955  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.92 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263275  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2730  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.47 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305906  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18630  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.77 
 
 		 381 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12921  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.13 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.197327  hitchhiker  0.00628301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3017  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  23.9 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0514274  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1688  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.7 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1725  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.66 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000975203  normal  0.54693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1261  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  29.03 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2965  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.21 
 
 		 181 aa  43.9  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0651  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  23.74 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0612  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.83 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11523  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0265  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.68 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0150738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1146  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.68 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000176363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1981  WbjC  24.24 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0053  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.12 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0537465  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1070  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.81 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.921927  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.83 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00257638  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1487  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.45 
 
 		 184 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.13 
 
 		 367 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0290  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26 
 
 		 181 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0280  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.33 
 
 		 181 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3120  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.39 
 
 		 183 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2039  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.22 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 		 369 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 		 372 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506617 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0255  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.03 
 
 		 191 aa  41.2  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000488402  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13113  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.83 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.611715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1252  hypothetical protein  24.81 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1473  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.17 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0401457  normal  0.0920932 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0068  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  23.53 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0839  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  22.88 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3385  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.33 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1389  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.67 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000175424  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0476  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.59 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000000424629  decreased coverage  0.00000000283912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1682  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.68 
 
 		 182 aa  40.8  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0542  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.52 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0592  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.52 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.430103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>