27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1604 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1604  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  100 
 
 		 145 aa  303  7e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.679828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2655  hypothetical protein  48.61 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1252  hypothetical protein  43.66 
 
 		 141 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2887  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  42.36 
 
 		 147 aa  123  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1258  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  39.31 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1910  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  39.58 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12921  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  43.85 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.197327  hitchhiker  0.00628301 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0875  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  41.22 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3696  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  37.24 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5 epimerase  33.56 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.930193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0185  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  34.69 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1213  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzyme  29.53 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0259  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.45 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4813  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.11 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841507  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2142  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.67 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0165  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related  30.14 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2215  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.63 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1887  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.17 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394283  normal  0.415914 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0055  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  28.77 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3931  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  36.36 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0053  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  34.85 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0537465  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2506  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.76 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0333  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.91 
 
 		 182 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0290  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.23 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1352  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  24.19 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0366  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.16 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2730  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  24.67 
 
 		 176 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>