31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0875 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0875  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  339  9e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1910  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  63.51 
 
 		 149 aa  197  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2887  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  66.44 
 
 		 147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3696  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  59.46 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1258  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  51.68 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1604  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  41.22 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.679828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2655  hypothetical protein  37.16 
 
 		 142 aa  101  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0185  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  35.33 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5 epimerase  34.67 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.930193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0259  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  36.6 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12921  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  34.11 
 
 		 143 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.197327  hitchhiker  0.00628301 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2142  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  34.39 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1252  hypothetical protein  35.71 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1213  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzyme  36.94 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1887  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.1 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394283  normal  0.415914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0165  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related  35.29 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3931  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  35.71 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0055  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  30.72 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4813  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  34.51 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841507  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2215  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.56 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1352  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  34.65 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2752  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related protein  34.25 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.711856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0053  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  38.27 
 
 		 184 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0537465  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2237  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.31 
 
 		 176 aa  47.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.551559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0651  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  35.8 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2030  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase  36.79 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0540  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  30.28 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0213  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  35.8 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315041  normal  0.523103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2463  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  29.25 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2651  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.12 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1754  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  29.25 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>