73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3386 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3386  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  269  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  98.46 
 
 
547 aa  267  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  98.46 
 
 
548 aa  267  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  96.92 
 
 
414 aa  265  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3464  hypothetical protein  91.3 
 
 
258 aa  223  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.888153  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  56.2 
 
 
559 aa  121  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  37.21 
 
 
538 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  37.21 
 
 
538 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  37.21 
 
 
538 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  37.21 
 
 
538 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  25.4 
 
 
526 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  32.23 
 
 
548 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  32.23 
 
 
548 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  32.23 
 
 
548 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  23.81 
 
 
532 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  23.81 
 
 
532 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  31.48 
 
 
562 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  31.48 
 
 
562 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  24.19 
 
 
510 aa  57  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  29.63 
 
 
562 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  35.96 
 
 
594 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0436  transposase  32.65 
 
 
513 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  29.27 
 
 
562 aa  52.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2371  transposase IS4 family protein  37.88 
 
 
511 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0572  transposase IS4 family protein  37.88 
 
 
511 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  29.6 
 
 
566 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  29.63 
 
 
561 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2408  transposase IS4 family protein  44.9 
 
 
508 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.28357  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0043  transposase IS4 family protein  44.9 
 
 
508 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5959  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  40.3 
 
 
642 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  35.82 
 
 
563 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  30.11 
 
 
522 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  35.82 
 
 
487 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2648  hypothetical protein  29.67 
 
 
275 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  29.63 
 
 
558 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  34.33 
 
 
563 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  34.33 
 
 
509 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  31.34 
 
 
596 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  31.34 
 
 
596 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1666  transposase IS4 family protein  41.51 
 
 
548 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.475975  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2142  transposase IS4 family protein  29.41 
 
 
520 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1562  transposase IS4 family protein  29.41 
 
 
520 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1050  transposase IS4 family protein  29.41 
 
 
520 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0161  transposase IS4 family protein  29.41 
 
 
520 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0284  hypothetical protein  25.24 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0264692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  29.63 
 
 
558 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3851  hypothetical protein  26.17 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126436  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  28 
 
 
586 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  29.09 
 
 
555 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1797  transposase IS4 family protein  27.66 
 
 
504 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1181  transposase IS4 family protein  27.66 
 
 
504 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4700  Transposase-like protein  27.66 
 
 
504 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  28.7 
 
 
540 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  29.85 
 
 
596 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  26.47 
 
 
632 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  25.24 
 
 
359 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  26.47 
 
 
632 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  26.47 
 
 
632 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  26.47 
 
 
632 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  26.47 
 
 
632 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2029  transposase IS4 family protein  39.62 
 
 
548 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.417393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  26.47 
 
 
632 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  26.47 
 
 
632 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  26.47 
 
 
632 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  48.57 
 
 
579 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1626  transposase IS4 family protein  32.89 
 
 
629 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.546345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  34.67 
 
 
570 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  34.67 
 
 
570 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  34.67 
 
 
570 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  34.67 
 
 
570 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1461  transposase IS4 family protein  32 
 
 
539 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  34.67 
 
 
570 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>