105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3304 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  748    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  49.6 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  43.75 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  44.89 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  43 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  44.17 
 
 		 400 aa  299  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  42.75 
 
 		 400 aa  295  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  36.84 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  41 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  39.65 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  40 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  39.45 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  39.45 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  43.14 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  42.21 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  39.5 
 
 		 401 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  39.5 
 
 		 401 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  39.5 
 
 		 401 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  39.5 
 
 		 401 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  41.46 
 
 		 399 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  39 
 
 		 401 aa  249  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  39.36 
 
 		 401 aa  249  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  41.1 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  41.32 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  39.25 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  39.36 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  39.36 
 
 		 401 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  38.64 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  36.78 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 		 400 aa  226  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  40.9 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  38.6 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  25.19 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  21.14 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  23.56 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  21.63 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  21.63 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  21.57 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  21.63 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  21.63 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  21.24 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  21.97 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  22.19 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  22.19 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  22.83 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.77 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  24.36 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  23.24 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  23.63 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  26.61 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  25.6 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  23.2 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  18.99 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  24.04 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  23.59 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 		 376 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  23.89 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  23.75 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  22.9 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  23.45 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  22.9 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  20.71 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  25.3 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  22.74 
 
 		 353 aa  50.1  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  23.86 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  25.07 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  23.25 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  22.5 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  26.49 
 
 		 389 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  23.12 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.33 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  23.74 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  32.99 
 
 		 410 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  25.79 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  23.77 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  31.31 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  24.63 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  24.43 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  22.01 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  25.93 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  20.71 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.65 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  24.07 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.57 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  26.55 
 
 		 392 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  26.4 
 
 		 779 aa  43.9  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  20.35 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  28.33 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>