58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3274 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3274  replication protein C  100 
 
 		 463 aa  954    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3518  replication protein C  54.34 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3307  replication protein C  49.66 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3578  replication protein C  51.61 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3847  replication protein C  38.1 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3743  replication protein C  31.33 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5212  replication protein C  29.58 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6492  replication initiation protein RepC  28.46 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578081  normal  0.568582 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4728  replication initiation protein RepC  29.32 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0167719  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7002  replication initiation protein RepC  27.54 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4192  replication initiation protein RepC  26.3 
 
 		 449 aa  123  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575341  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6315  replication initiation protein RepC  27.55 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5557  replication initiation protein RepC  26.32 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.539065  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5465  replication initiation protein RepC  26.58 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728994  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4791  replication initiation protein RepC  24.35 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0348646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5195  replication initiation protein RepC  27.27 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479009  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5478  replication protein C  25.31 
 
 		 397 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4573  replication initiation protein RepC  27.85 
 
 		 441 aa  114  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4356  replication initiation protein RepC  25.71 
 
 		 436 aa  113  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5617  replication initiation protein RepC  26.3 
 
 		 403 aa  113  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  0.1269 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4519  replication initiation protein RepC  28.27 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6052  replication initiation protein RepC  27.25 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4102  replication initiation protein RepC  29.44 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6499  replication initiation protein RepC  27.11 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8002  replication initiation protein RepC  26.19 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9503  replication initiation protein RepC  26.3 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.812496  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9802  replication initiation protein RepC  25.99 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4279  replication initiation protein RepC  27.8 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5175  replication initiation protein RepC  27.21 
 
 		 402 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.940689 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0003  replication initiation protein RepC  25.51 
 
 		 410 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.176403 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6015  replication initiation protein RepC  25.12 
 
 		 404 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241299  normal  0.0884238 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4585  replication initiation protein RepC  28.41 
 
 		 402 aa  106  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342951  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4545  replication initiation protein RepC  27.05 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000970049  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5002  replication initiation protein RepC  26.52 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6164  replication initiation protein RepC  27.44 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4539  replication protein C  27.4 
 
 		 426 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9003  replication initiation protein RepC  27.94 
 
 		 425 aa  100  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4523  replication protein C  27.78 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4021  replication initiation protein RepC  27.63 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0836066  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4352  replication protein C  24.06 
 
 		 510 aa  97.8  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8201  replication protein C  23.49 
 
 		 420 aa  94  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9901  replication protein C  27.71 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4091  replication initiation protein RepC  23.6 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7387  replication initiation protein RepC  29.89 
 
 		 403 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0522109  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0001  replication initiation protein RepC  26.63 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000463229  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0001  replication initiation protein RepC  26.63 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0000780198  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4534  replication initiation protein RepC  24.82 
 
 		 409 aa  87.4  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171833  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7170  replication initiation protein RepC  24.88 
 
 		 404 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.611656 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4454  replication initiation protein RepC  25.37 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000305479  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4673  replication initiation protein RepC  24 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795388  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4021  replication initiation protein RepC  25 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4709  replication initiation protein RepC  30.56 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8700  replication protein C  39.29 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4381  hypothetical protein  23.34 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5911  replication protein C  35.71 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.547338  normal  0.0252252 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3896  replication protein C  24.94 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00360794  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7390  transposase  24.05 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2394  hypothetical protein  26.17 
 
 		 365 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542724  normal  0.67832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>