More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2983 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2983  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
352 aa  681    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0403702  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2190  Monosaccharide-transporting ATPase  59.4 
 
 
343 aa  352  7e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.87 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 
311 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.14 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.1 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.14 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 
311 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  35.83 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.46 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.46 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.52 
 
 
323 aa  162  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  37.97 
 
 
329 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  38.65 
 
 
311 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 
330 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.99 
 
 
330 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.41 
 
 
324 aa  160  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.99 
 
 
330 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  35.33 
 
 
337 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  35.33 
 
 
337 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  35.33 
 
 
337 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  35.33 
 
 
337 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  36.69 
 
 
337 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  33.54 
 
 
327 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  32.94 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  38.65 
 
 
314 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  34.76 
 
 
337 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  34.25 
 
 
322 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  36.24 
 
 
333 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  34.92 
 
 
340 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.09 
 
 
352 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  39.64 
 
 
322 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2602  inner-membrane translocator  36.25 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355907  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  33.13 
 
 
327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  36 
 
 
337 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 
835 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  35.39 
 
 
314 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 
312 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  35.9 
 
 
340 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  34.21 
 
 
351 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.03 
 
 
309 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  35.81 
 
 
335 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
334 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
332 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
334 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.86 
 
 
310 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  35.86 
 
 
310 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  33.88 
 
 
351 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  39.93 
 
 
327 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  33.88 
 
 
351 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.42 
 
 
323 aa  149  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  40.07 
 
 
317 aa  149  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  37.84 
 
 
325 aa  149  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.88 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  34.45 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3970  inner-membrane translocator  37.38 
 
 
367 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265125  normal  0.0124172 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  40.78 
 
 
353 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  35.79 
 
 
317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.97 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.54 
 
 
324 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  33.97 
 
 
342 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  37.62 
 
 
325 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  38.26 
 
 
335 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  42.45 
 
 
319 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1196  ribose ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 
334 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  36.15 
 
 
322 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  34.09 
 
 
342 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1640  carbohydrate ABC transporter permease  38.26 
 
 
334 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.367254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0858  carbohydrate ABC transporter permease  38.26 
 
 
334 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0302  carbohydrate ABC transporter permease  38.26 
 
 
334 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0470774  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.46 
 
 
306 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2071  ribose ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  37.28 
 
 
318 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
352 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1909  carbohydrate ABC transporter permease  38.26 
 
 
339 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.071894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1922  carbohydrate ABC transporter permease  38.26 
 
 
339 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  39.41 
 
 
334 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 
313 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  37.71 
 
 
349 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  35.89 
 
 
341 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  35.4 
 
 
341 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  37.05 
 
 
332 aa  142  7e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  32.94 
 
 
346 aa  142  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  34.46 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  35.9 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1488  inner-membrane translocator  35.21 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  36.03 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0344  monosaccharide-transporting ATPase  35.97 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.324095  normal  0.0533702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  33.64 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1460  inner-membrane translocator  31.69 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  37.59 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 
322 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  36.29 
 
 
317 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>