More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2559 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  100 
 
 
407 aa  814    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  48.48 
 
 
406 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  48.48 
 
 
406 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  48.48 
 
 
406 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  47.72 
 
 
420 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  48.48 
 
 
406 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  47.97 
 
 
406 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  48.22 
 
 
406 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  52.26 
 
 
416 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  47.21 
 
 
408 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  47.21 
 
 
408 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  47.21 
 
 
406 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  47.21 
 
 
408 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  47.21 
 
 
408 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  47.21 
 
 
408 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  47.21 
 
 
408 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  46.95 
 
 
408 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  51.98 
 
 
416 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  47.25 
 
 
406 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  47.25 
 
 
406 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  49.73 
 
 
403 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  46.49 
 
 
422 aa  350  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  47.11 
 
 
407 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  45.59 
 
 
410 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  45.01 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1653  major facilitator superfamily MFS_1  44.14 
 
 
430 aa  280  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389792  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01360  carboxylic acid transport protein, putative  39.71 
 
 
542 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00179855  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85334  Carboxylic acid transporter protein homolog  37.72 
 
 
493 aa  250  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06703  sugar transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05550)  35.65 
 
 
495 aa  233  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06095  carboxylic acid transport protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09450)  38.19 
 
 
514 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749433  hitchhiker  0.00628385 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01350  lactate transporter, putative  38.51 
 
 
547 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.19632  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30177  carboxylic acid transporter protein  33.07 
 
 
520 aa  189  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0149724  normal  0.0565304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  33.93 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  32.78 
 
 
409 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  33.33 
 
 
409 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  33.33 
 
 
409 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  30.46 
 
 
496 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  30.46 
 
 
496 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  30.46 
 
 
496 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  30.46 
 
 
496 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  30.46 
 
 
496 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  32.96 
 
 
423 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  32.03 
 
 
425 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  31.73 
 
 
425 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  31.18 
 
 
411 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  29.74 
 
 
496 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  29.49 
 
 
496 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  29.49 
 
 
496 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  29.49 
 
 
496 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  29.49 
 
 
496 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  29.49 
 
 
496 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  29.49 
 
 
496 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  30.2 
 
 
495 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  28.93 
 
 
496 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  28.93 
 
 
496 aa  152  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 
411 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  34.53 
 
 
436 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  30.23 
 
 
429 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
428 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  27.79 
 
 
510 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  27.79 
 
 
510 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
423 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
482 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  27.79 
 
 
510 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  32.15 
 
 
434 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  28.46 
 
 
428 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  28.15 
 
 
405 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  28.15 
 
 
405 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  28.15 
 
 
405 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  32.32 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  31.67 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  32.24 
 
 
434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  32.32 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  32.32 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  32.04 
 
 
420 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  32.04 
 
 
420 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  29.21 
 
 
424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  29.21 
 
 
424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  32.32 
 
 
432 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  29.97 
 
 
426 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  31.9 
 
 
432 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  31.77 
 
 
420 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  31.75 
 
 
435 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  31.99 
 
 
434 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  28.93 
 
 
428 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  29.12 
 
 
426 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  29.12 
 
 
426 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  28.93 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  27.78 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  30.77 
 
 
437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.66 
 
 
427 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  28.65 
 
 
415 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  31.28 
 
 
419 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>