More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1523 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1523  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 
66 aa  134  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.478782  normal  0.638647 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0372  cold shock protein  69.84 
 
 
66 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.69681e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.58 
 
 
66 aa  99.4  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 
65 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  68.75 
 
 
66 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2370  cold shock proteins  66.67 
 
 
66 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.71289e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  68.75 
 
 
67 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.44 
 
 
65 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  68.75 
 
 
67 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 
65 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  67.19 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  67.19 
 
 
65 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  67.19 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  67.19 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2806  cold shock proteins  68.25 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.72104e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  67.19 
 
 
65 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  67.19 
 
 
65 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
69 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  67.19 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 
65 aa  94.4  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3612  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.49 
 
 
68 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000433441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 
69 aa  94  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
68 aa  93.6  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.35 
 
 
66 aa  93.6  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  69.35 
 
 
66 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 
65 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3704  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 
69 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.35 
 
 
66 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39180  Cold-shock-like protein  69.35 
 
 
69 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197755  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 
65 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0778  cold shock proteins  65.62 
 
 
66 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 
66 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000020604  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.52 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.754516  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3308  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 
66 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.93 
 
 
68 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0644  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  92  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000253244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  67.19 
 
 
65 aa  92.8  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3558  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.9 
 
 
69 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.93 
 
 
69 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4220  cold-shock protein  66.67 
 
 
69 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49410  cold-shock protein  66.67 
 
 
69 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000191939  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0658  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 
66 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.18008e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  67.74 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1336  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
68 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.57 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  69.35 
 
 
66 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 
66 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1953  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.52 
 
 
69 aa  90.9  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0846226  normal  0.0196408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0645  cold-shock DNA-binding domain protein  61.9 
 
 
66 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.57 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2955  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 
68 aa  90.9  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  63.93 
 
 
68 aa  90.5  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.3 
 
 
68 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  68.25 
 
 
77 aa  90.1  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 
66 aa  90.1  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  68.25 
 
 
66 aa  90.1  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  62.5 
 
 
66 aa  89.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.49 
 
 
66 aa  89.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1846  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.52 
 
 
69 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.174737  normal  0.594257 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.93 
 
 
68 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2133  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.52 
 
 
69 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4183  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.06 
 
 
67 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0862888  normal  0.391924 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
67 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2222  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 
66 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2005  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 
66 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1727900000000003e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  68.25 
 
 
66 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0191  cold-shock domain-contain protein  61.54 
 
 
66 aa  88.6  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0333  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.52 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000434433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  65.08 
 
 
66 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1085  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.21 
 
 
69 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0927739  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2627  cold-shock DNA-binding domain protein  66.13 
 
 
66 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 
66 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 
65 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3185  cold-shock DNA-binding domain protein  62.9 
 
 
66 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000997397  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2649  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139093  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2170  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.52 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05490  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.57 
 
 
68 aa  88.6  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.94484e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.49 
 
 
66 aa  89.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 
67 aa  89.4  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.13 
 
 
65 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  62.9 
 
 
66 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  67.74 
 
 
83 aa  89.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000468526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  64.06 
 
 
65 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  64.06 
 
 
65 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.5 
 
 
65 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.68 
 
 
69 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  64.06 
 
 
65 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3069  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 
69 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0986156  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.35 
 
 
67 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2290  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 
68 aa  88.2  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.388252  hitchhiker  0.00970612 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0979  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000188175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3065  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.33 
 
 
66 aa  88.2  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000279167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  66.67 
 
 
69 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>