58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0227 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0227  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  243  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1824  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  35.53 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1266  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2441  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  32.89 
 
 		 238 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  32.89 
 
 		 238 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2543  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0592097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 209 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.33 
 
 		 481 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  34.43 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  26.97 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  32.79 
 
 		 70 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  35 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  31.67 
 
 		 302 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0098  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 72 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0675  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.84 
 
 		 297 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3707  molybdate metabolism transcriptional regulator  39.71 
 
 		 374 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 528 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 101 aa  41.2  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4900  hypothetical protein  36.76 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978216  normal  0.040659 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  34.52 
 
 		 244 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 403 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1502  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 136 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 171 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>