57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2708 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 89 aa  178  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  79.78 
 
 		 107 aa  147  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  57.83 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  58.33 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  49.4 
 
 		 136 aa  87.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  58.67 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  48.31 
 
 		 89 aa  83.6  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  45.68 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  53.85 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  53.23 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  44.59 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  49.38 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  45.95 
 
 		 75 aa  73.6  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  56.94 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  50.6 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  43.53 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  49.38 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  48.39 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  40.91 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  42.19 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  46.34 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  52.63 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  41.77 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  35.23 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  56 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  47.56 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  46.34 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  32.47 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  43.21 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  40.85 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  37.1 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  48.39 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  53.23 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  45.61 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  45.61 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  42.11 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  35.62 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  52.73 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  40.35 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  44.16 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  43.1 
 
 		 59 aa  43.5  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  42 
 
 		 72 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  43.75 
 
 		 76 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  44.44 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  42.31 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  32.35 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  32.35 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0582  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>