108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1864 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1864    100 
 
 		 1154 bp  2288    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0429575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  86.03 
 
 		 1560 bp  119  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  86.03 
 
 		 1560 bp  119  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  85.29 
 
 		 1491 bp  111  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  85.29 
 
 		 1578 bp  111  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 1560 bp  107  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 1560 bp  107  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 1560 bp  107  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2953    88.78 
 
 		 2534 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.100648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  88.78 
 
 		 1374 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  88.78 
 
 		 1374 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  88.78 
 
 		 1374 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3877    88.78 
 
 		 2364 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  88.78 
 
 		 1374 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  88.78 
 
 		 1374 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  88.78 
 
 		 1374 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  88.78 
 
 		 1374 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1841    88.78 
 
 		 2619 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.348274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  88.78 
 
 		 1374 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  88.78 
 
 		 1374 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  88.78 
 
 		 1374 bp  107  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  89.01 
 
 		 1272 bp  101  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  89.01 
 
 		 1272 bp  101  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  89.01 
 
 		 1272 bp  101  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  89.01 
 
 		 1272 bp  101  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  89.01 
 
 		 1272 bp  101  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  88.64 
 
 		 1158 bp  95.6  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  88.64 
 
 		 1158 bp  95.6  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3055  Integrase catalytic region  88.37 
 
 		 1071 bp  91.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3165  Integrase catalytic region  88.37 
 
 		 1071 bp  91.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  87.64 
 
 		 1020 bp  89.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  87.64 
 
 		 1020 bp  89.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  87.64 
 
 		 1020 bp  89.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  91.18 
 
 		 1209 bp  87.7  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2754    91.18 
 
 		 1400 bp  87.7  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  90.14 
 
 		 1032 bp  85.7  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1285    90.14 
 
 		 282 bp  85.7  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.305935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  86.52 
 
 		 1029 bp  81.8  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  89.71 
 
 		 1401 bp  79.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 981 bp  79.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 981 bp  79.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 981 bp  79.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 981 bp  79.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  85.71 
 
 		 981 bp  77.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6837    84.38 
 
 		 741 bp  71.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9209    90.74 
 
 		 544 bp  67.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  84.27 
 
 		 1029 bp  65.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4442  transposase, ISlxx5  86.96 
 
 		 285 bp  65.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0515    83.7 
 
 		 1415 bp  63.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0167322  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  90.2 
 
 		 1440 bp  61.9  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0572    90.2 
 
 		 2253 bp  61.9  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  90.2 
 
 		 1440 bp  61.9  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  90.2 
 
 		 1440 bp  61.9  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  89.09 
 
 		 1200 bp  61.9  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4654  integrase catalytic subunit  89.09 
 
 		 1200 bp  61.9  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  85.33 
 
 		 1266 bp  61.9  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3082  integrase catalytic subunit  90 
 
 		 762 bp  60  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  85.14 
 
 		 1230 bp  60  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  87.72 
 
 		 1029 bp  58  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  87.72 
 
 		 1029 bp  58  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  87.72 
 
 		 1029 bp  58  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  87.72 
 
 		 1029 bp  58  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  87.72 
 
 		 1029 bp  58  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  87.72 
 
 		 1029 bp  58  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  87.72 
 
 		 1029 bp  58  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  87.72 
 
 		 1029 bp  58  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  87.72 
 
 		 1029 bp  58  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0368  integrase catalytic subunit  84.93 
 
 		 579 bp  58  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.810172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3625  integrase, catalytic region  86.15 
 
 		 249 bp  58  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290027  normal  0.12357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  87.72 
 
 		 1020 bp  58  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03433  ISXoo15 transposase  89.8 
 
 		 948 bp  58  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3263  integrase  83.75 
 
 		 570 bp  56  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17800    85.29 
 
 		 2354 bp  56  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.750484  normal  0.695499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  85.29 
 
 		 1398 bp  56  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1425 bp  54  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1245 bp  54  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1425 bp  54  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1314 bp  54  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1314 bp  54  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1425 bp  54  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1314 bp  54  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1314 bp  54  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1206 bp  54  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 		 1206 bp  54  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  87.27 
 
 		 1203 bp  54  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0710    86.44 
 
 		 5675 bp  54  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    86.44 
 
 		 2569 bp  54  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  83.33 
 
 		 1362 bp  52  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1401 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1401 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1401 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1722    88.89 
 
 		 3771 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1401 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1915    88.89 
 
 		 1400 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.590164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1446 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2800    88.89 
 
 		 3468 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1401 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1401 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2930    88.89 
 
 		 1400 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 1401 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>