More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3881 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3881  transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.58 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  38.75 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  38.8 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  40.72 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  40.41 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  40.55 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  39.46 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 322 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  37.46 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4365  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  38.33 
 
 		 311 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  38.33 
 
 		 311 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 346 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 343 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  38.54 
 
 		 369 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 346 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 369 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 346 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  38.54 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 		 338 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 342 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  34.93 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  35.76 
 
 		 358 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  35.15 
 
 		 354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 341 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  36.81 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 361 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  36.91 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.57 
 
 		 321 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  35.81 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  36.58 
 
 		 334 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  38.33 
 
 		 320 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  38.33 
 
 		 320 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  35.84 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  38.43 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  36.55 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 363 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  35.86 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  33.8 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  38.31 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  35.52 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  40.31 
 
 		 437 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 344 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.52 
 
 		 344 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.52 
 
 		 344 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.52 
 
 		 344 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  36.5 
 
 		 375 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 348 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 330 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>