More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1256 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4772  phospholipase D/Transphosphatidylase  60.26 
 
 
583 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3191  phospholipase D/transphosphatidylase  63.71 
 
 
576 aa  685    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269008  normal  0.521574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2543  phospholipase D/Transphosphatidylase  65.23 
 
 
567 aa  686    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.43955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1256  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
625 aa  1234    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20488  normal  0.0365091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5200  phospholipase D/transphosphatidylase  53.63 
 
 
604 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4230  phospholipase D/transphosphatidylase  46.76 
 
 
575 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0412  phospholipase D/transphosphatidylase  46.49 
 
 
560 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127464  hitchhiker  0.00000145574 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.96 
 
 
564 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.96 
 
 
564 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2014  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.01 
 
 
551 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  34.89 
 
 
516 aa  287  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3791  phospholipase D/transphosphatidylase  34.39 
 
 
516 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102545  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  34.38 
 
 
538 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2103  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.94 
 
 
517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1811  phospholipase D/transphosphatidylase  35.08 
 
 
532 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  36.74 
 
 
548 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2154  putative phospholipase D precursor  34.18 
 
 
517 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230523  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3039  phopholipase D domain-containing protein  31.33 
 
 
510 aa  262  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  30.43 
 
 
522 aa  262  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  35.54 
 
 
558 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0142  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.29 
 
 
527 aa  253  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150882  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3993  phospholipase D/transphosphatidylase  32.32 
 
 
517 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.927932  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2346  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.26 
 
 
524 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2946  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.83 
 
 
557 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378913  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  35.96 
 
 
553 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0663  phospholipase D/transphosphatidylase  30.82 
 
 
535 aa  246  8e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000324106  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2752  phospholipase D/transphosphatidylase  34.9 
 
 
540 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5532  phospholipase D/transphosphatidylase  31.16 
 
 
522 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2139  phospholipase D/transphosphatidylase  34.9 
 
 
540 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  34.54 
 
 
549 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2777  phospholipase D/transphosphatidylase  34.9 
 
 
540 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326922  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5034  phospholipase D/transphosphatidylase  33.28 
 
 
543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258367  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5186  phospholipase D/transphosphatidylase  32.52 
 
 
517 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0217001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  31.68 
 
 
495 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  31.2 
 
 
514 aa  238  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2801  phospholipase D/transphosphatidylase  34.03 
 
 
540 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70110  putative cardiolipin synthase  33.33 
 
 
529 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  35.34 
 
 
550 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  33.87 
 
 
541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5276  phospholipase D/transphosphatidylase  32.8 
 
 
517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2668  phospholipase D/transphosphatidylase  33.93 
 
 
540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  36.08 
 
 
550 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  36.08 
 
 
595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  36.52 
 
 
550 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  36.08 
 
 
550 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  36.08 
 
 
550 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  36.08 
 
 
550 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0095  phospholipase D family protein  30.61 
 
 
542 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  31.35 
 
 
540 aa  230  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0229  phospholipase D/transphosphatidylase  30.77 
 
 
526 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0194  phospholipase D/transphosphatidylase  32.22 
 
 
518 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316787  hitchhiker  0.000208167 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0796  phospholipase D/transphosphatidylase  33.4 
 
 
562 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829142  normal  0.0553202 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.04 
 
 
493 aa  227  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  32.66 
 
 
476 aa  226  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  32.48 
 
 
473 aa  226  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2285  phopholipase D  32.48 
 
 
476 aa  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  32.48 
 
 
473 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  32.48 
 
 
473 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2055  phospholipase D/transphosphatidylase  31.9 
 
 
515 aa  225  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0614113  normal  0.204663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  32.48 
 
 
476 aa  225  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1167  phopholipase D  32.48 
 
 
476 aa  225  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  32.3 
 
 
473 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1215  phopholipase D  31.49 
 
 
434 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.192537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1244  phopholipase D  31.49 
 
 
434 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1259  phopholipase D  31.49 
 
 
434 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2225  phopholipase D  31.49 
 
 
434 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2041  phopholipase D  31.49 
 
 
434 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00421548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5328  phospholipase D/transphosphatidylase  31.69 
 
 
517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0620748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  30.03 
 
 
516 aa  220  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1732  phospholipase D/transphosphatidylase  26.73 
 
 
543 aa  214  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.229068  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.02 
 
 
534 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  32.72 
 
 
529 aa  209  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  45.38 
 
 
516 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  43.92 
 
 
560 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  45.38 
 
 
516 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0797  phospholipase D/transphosphatidylase  27.61 
 
 
566 aa  195  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0791  phospholipase D  26.91 
 
 
570 aa  192  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  45.38 
 
 
534 aa  190  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1121  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.3 
 
 
535 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2081  putative phospholipase D  39.56 
 
 
510 aa  170  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  44.26 
 
 
505 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5202  phospholipase D/transphosphatidylase  42.23 
 
 
602 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.440648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6085  putative lipoprotein  43.58 
 
 
517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1456  phospholipase D/transphosphatidylase  41.03 
 
 
522 aa  163  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  38.78 
 
 
518 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.31 
 
 
519 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.77 
 
 
529 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2100  phospholipase D/transphosphatidylase  37.4 
 
 
506 aa  153  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2900  phospholipase D/transphosphatidylase  37.3 
 
 
507 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0104537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  39.41 
 
 
508 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1771  phospholipase D/transphosphatidylase  35.56 
 
 
515 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0845  phospholipase D/transphosphatidylase  40.81 
 
 
517 aa  150  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  37.78 
 
 
540 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  35.57 
 
 
544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  37.18 
 
 
505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1462  phospholipase D/transphosphatidylase  36.36 
 
 
514 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0473  phospholipase-D family protein  38.33 
 
 
516 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  38.33 
 
 
516 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  40.76 
 
 
516 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0871  phospholipase D/transphosphatidylase  41.34 
 
 
520 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336385  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>